水溶肥的溶解度好，易被作物吸收，养分效率高，满足了设施生产标准化、化、省水省工的要求。但施肥人员往往把重点放在灌溉系统的操作和使用，而忽视了水溶肥本身作为化肥也要按配方施用。这里的配方不仅是指氮磷钾的数量，还要考虑土壤、作物、水和其化学性质等因素，合理安排种类、数量和施用时机。
1、水溶肥施用必须精量控制
许多研究表明，根层土壤溶液养分浓度与作物生长及产量有密切的关系，维持根层土壤溶液养分浓度，作物对养分的吸收和利用。水溶肥一般由易溶的化肥（如硝酸钙、硝酸钾、磷酸二氢钾）等组成，养分含量也比一般复合肥养分含量高。
随水进入土壤后，可以很快提高土壤溶液养分浓度，促进作物吸收。但同时也会加快土壤离子代换反应，因此，水溶肥使用方法比其它肥料更复杂，必须精量控制。如果不能科学施用会引起土壤次生盐渍化或养分拮抗作用发生，影响作物生长。例如，现在已经出现由于过量施用高钾水溶肥，导致番茄等对钙、镁等吸收不足，发生脐腐病的现象。
2、根据土壤条件施用
土壤酸碱度不同，应选择相应的生理性酸性或碱性肥料中和。
酸性土壤要使用生理碱性水溶肥，如硝酸钠来中和酸度；
碱性土壤则选择生理酸性肥料，如硫酸钾来中和碱度。
结构不良土壤（砂性土、薄层土或黏重土），减少硝态氮肥使用。因肥料容易随水流失或因渍水引起的反硝化作用，如果要用，应基施腐熟有机肥配合。对于已出现盐渍化的土壤，要慎重使用高浓度水溶肥，选用中性中低浓度水溶肥。
3、作物不同，配方不同
由于水溶肥容易被吸收，施用水溶肥后，作物会相应减少对土壤养分的利用，因此，它比其它肥料对作物生长影响更大，用量、比例和时机与作物水肥需求规律的一致要求也更高。因此，要按蔬菜需肥规律施用。
●变量需肥型
如西瓜、花椰菜、甘蓝、萝卜等，这类蔬菜生育期长但采收期短，前期主要是茎叶生长，生长量小，需肥量小，中后期植株长势旺盛，需肥量大。
这类作物前期适合用低浓度氮钾肥，避免氮肥过多引起植株徒长。生长后期渐次加大氮、钾肥用量，采用高氮高钾肥。像西甜瓜一类果类作物还可补充少量磷肥。
●稳定需肥型
这种类型蔬菜多为无限生长型果类蔬菜，生育期和采收期都较长，如番茄、黄瓜等，这种类型蔬菜生长前期要根系发育良好，培育健株。收获期间保持肥效长久，长期维持植株长势。
生长前期使用低浓度氮钾肥，稳定植株生长。坐果后使用高浓度氮钾肥，进入采收期后施用氮磷钾三元水溶肥，作物需要。
●早发需肥型
这类蔬菜包括茼蒿、油菜一类的小叶菜。生育期较短，总需肥量不大。这些蔬菜喜氮，水溶肥以含氮肥料为主。在氮含量较高地块，宜用低氮水溶肥并控制用量，减少植株硝酸盐含量。追肥次数一般2-3次即可。
此外，水溶肥用量还要依据叶片营养诊断，即缺即补。在养分缺乏地块，选用氮、磷、钾为主的水溶性肥料；在基肥施用充足时或肥力高的地块，选用微量元素为主的水溶性肥料。
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