微生物菌剂是指利用多孔物质作为吸附剂，吸附菌体的发酵液加工制成的活菌制剂。农用微生物菌剂恰当使用可以改善农作物品质、减少化肥用量、改善土壤、保护生态环境等。
一、微生物菌剂的分类
按菌种的组成可分为：单一菌剂（一种微生物菌种制成）和复合菌剂（两种或以上互不拮抗的微生物菌种制成）；
按功能类型可分为：固氮菌菌剂、根瘤菌菌剂、硅酸盐菌剂、溶磷微生物菌剂、光合菌剂、菌根菌剂、促生菌剂、有机物料腐熟菌剂、生物修复菌剂。
二、微生物菌剂的作用
1、提高作物产量
有效菌可以分泌赤霉素、细胞分裂素、生长素等物质，可以刺激、调节、促进作物的生长发育，利于作物增产。
2、改善作物品质
分解、释放多种中微量元素，可以使作物更好的吸收，提高作物体内蛋白质、氨基酸、糖分等含量。
3、增强作物抗逆性
有效菌可以分泌多种抑菌物质、类物质和多种活性酶的功能，可以抑制或者杀死多种土传病害，降低病害发生的概率，增强作物抗旱、耐寒、抗倒伏及抗盐碱能力等，还可以有效预防作物生理性病害的发生。
4、提高化肥利用率
有效菌可以分解土壤中的有机质，并且生成腐殖酸可与土壤中的氮形成腐殖酸铵，减少氮肥流失。叶虹时光微生物菌剂还具有很好的解磷、解钾的作用，可以将土壤中无效态的磷、钾转化为有效态的磷钾。
5、改善土壤环境
有效菌可以促进土壤中难溶性养分的溶解和释放，提高土壤养分供应能力；分泌的胞外多糖可以增强土壤的团粒结构，疏松土壤，提高土壤通透性和保水保肥能力，增加土壤有机质的含量，改善土壤养分供应状况。
三、微生物菌剂使用方法
1.育苗时开始使用效果佳
提前一天，浸种十五分钟至半个小时，然后阴凉处晾干，提前一二天，均匀混拌育苗基质，略蘸小水浇洒，让菌剂提前定植繁殖生长。覆盖薄膜，以免杂菌混入。
微生物菌剂越早使用越好，为什么这样说呢？因为微生物菌剂当中含有的有益菌，可以促进土壤当中有益菌的繁殖，并且抑制杂菌的生长，对土壤的理化性质起到很好的改善作用，并且能够改善土壤因长期使用化肥而造成的土壤板结、酸化、盐渍化等一系列土壤性问题。
并且微生物菌剂还能提高作物的抗逆能力，提高作物抗病虫害能力。所以在育苗期就开始使用生物菌剂，对作物的病虫害提前预防起到了很好的保护作用，间接地减少了因病虫害而造成的经济损失。
2.定植穴施或沟施
穴施为佳，均匀混拌麦麸、碎磨稻糠、豆粕等有机质，若少量添加玉米粉、黄豆粉尤佳（为避免豆粕等有机质烧苗，尽量使用腐熟过的，并添加晒干的泥土）。施入后及时覆土。
微生物菌剂为什么穴施效果佳？作物的生长离不开营养，而作物叶片光合作用供给的营养只占很少一部分，大部分的营养供给都是来自于作物的根系吸收。所以根系的生长及根系周围土壤环境健康是十分有必要的。只有了根系周围土壤环境营养丰富，有机质充足，就能根系很好地生长，为作物提供全生长周期的营养需求。
3.混拌底肥、有机质旋耕进土下
若次使用微生物菌剂，建议加倍用量，旋耕下底肥时使用。
这是为什么呢？因为长期使用化肥的土壤，比如连作三年以上的土壤，土壤营养平衡一般就会被打破，常年使用的就会发生一系列土壤问题，严重危害了作物的质量和产量。
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