微生物菌剂对果品品质的影响在苹果、葡萄、梨、草莓和猕猴桃等多个树种上的研究结果表明，微生物菌剂肥料明显提高了果品品质。
内在品质上主要提高了果实的可溶性固形物和含糖量、糖酸比和香气品质；从外在品质看，提高了果实着色度和硬度，果形大小较匀称。
苹果可溶性固形物由14.1%提高到15.6%，桃由10.1%提高到11.3%，葡萄由15.1%提高到16.6%；苹果的糖酸比由19.6提高到28.2。
对果树产量的影响
在苹果、柑橘、桃、葡萄、李子、梨等果树上的研究结果表明，施用微生物菌剂肥料有效增加了果实单果重并显着提高了单位面积产量，果园施用微生物菌剂肥料后，苹果、桃、葡萄、李子的产量，分别增产29.8%、27.7%、12.6%、21.1%；同时单果重增加明显，苹果增加35.9%，葡萄增加28.4%。
对树体生长发育的影响
研究表明，设施桃树上施用微生物菌剂肥料后，显着提高了土壤温度，10厘米根际土壤温度平均升高2.2℃；促进了土壤表层根系的发生与生长，细根数量比对照增加1.5倍；明显提高了桃的坐果率，比对照提高45.6%；成熟期提前，比对照早熟10~12天。在设施草莓上施用微生物菌剂肥料后，植株生长明显改善，所有指标均高于对照。
对土壤理化性质的影响
研究结果表明，施用微生物菌剂肥料后，果园土壤容重变小，土壤孔隙度增大，增加了土壤微生物数量，土壤透气性得到改善，有机质含量明显提高，土壤供氮和供磷能力增强，土壤酸碱性得到改善，有利于土壤中养分的释放。
果园施用微生物菌肥有讲究
1、选购微生物菌肥时，要注意生产日期，不用过期产品，一般超过生产日期1年的生物菌肥活性就会显著降低。
2、看微生物菌肥有无农业部登记证，正规生产厂家的产品都应该有农业部登记证号，省级农业厅不批准生物菌肥登记。所以凡是印有××省农肥登记的生物菌肥都是假冒产品，严防普通有机肥冒充生物菌肥。
3、微生物菌肥还要看活菌数量是否符合国家规定，国家规定生物菌剂有效活菌数≥2亿/克，颗粒状的≥1亿/克，符合生物肥料和微生物肥料的有效活菌数≥2000万/克。
4、微生物菌肥不宜与杀菌剂、杀虫剂、除草剂同时使用，也不要在使用生物菌肥后再实行土壤。
5、生物菌肥施入土壤后，有一个菌群繁殖壮大的过程，因此，在果树根系开始生长前使用。
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