棉花出苗受多种因素影响，在田间表现的迹象各有不同，当田间出现苗情差后，总有主因和附带因素并存，或单一因素影响，一般可划为下列几种情况：
一、种子问题
这类情况在田间表现的迹象是：在幼苗现行3-4天以后，出苗率仍未达85%，在棉田一膜四行六行中带有一定的规律性，缺苗比例大并且很均匀，从缺苗处淘出种子未发芽的多数为无生命的死胚种子，种子多已发霉、用手捏发粘。
在整块地无成片出苗正常的苗相。这类种子只有种在气温偏高的时间出苗率情况相对要好一些。遇到这样的地块，出苗率在60%以上的应及时催芽补种。
二、气候的问题
棉种播种后如遇到低温，日平均气温低于12℃以下或大风、霜冻、冰雹，吸足水分的种子胚已萌动，或已破土而出的幼苗就会因灾害性天气的强弱而造成不同程度出苗率低的情况，幼苗会发生立枯病、炭疽病、根腐等病害。
采取技术措施中耕、提高地温，并对已出苗的棉田喷施营养液和杀菌剂，以便提高抗灾和恢复正常生长的能力。建议用多菌灵、敌克松等杀菌剂，每亩地配合50克磷酸二氢钾、芸苔素内酯或海藻素混合喷洒2-3次、间隔4-5天。
三、棉田土地的问题
（1）盐碱地
新疆土壤均含盐碱，但棉花具有中等耐盐能力，轻盐碱对棉花生长影响不大，但盐碱含量偏高就会严重影响出苗和生长。盐碱含量偏高的棉田在灌溉后表土直观有白色、或黑色盐斑。
（2）湿度大
播前整地时水分大，播种遇低温后土壤温度下降快、升温慢，极容易造成烂种烂芽。干播湿出滴水量大的逢种子萌动遇低温更易造成烂芽，出苗差。
（3）土壤墒干
因灌水不匀或因种种原因而墒度不够，使棉种无法吸足水分，墒干而影响正常出苗，这类棉田在膜下露水珠较少，手从膜下取土干燥，手捏不能成团。掏出膜下种子，胚无萌动，破壳后种子胚是白色的，无霉烂或发粘迹象。种子生命正常，灌水后会正常出苗。
（4）覆土模式
近两年内在一些区域出现不正确的封土方式，侧封土敞口播种害怕破板结，却没有意识到带来的麻烦，不保温、不保墒降雨更容易形成瓶塞子影响出苗，高温水分蒸发速度快易出现吊死苗。
（5）整地质量差
棉田高低不平，土壤不够松碎，基肥撒施不匀或耕翻深度不够等，均可造成局部地方出苗，或四行中其中二行好、另二行差的情况，或在地的一端出苗好，另一端出苗不好，中间地段有好有差。土地整理过松极易造成错眼、很难掌握播种深度，以致出苗受到影响。
（6）地膜残留过多
棉苗根系被地膜残片裹，水肥吸收受阻，也会造成死亡。
（7）地老虎危害
地老虎啃食根系造成棉苗死亡。
（8）除草剂使用不当
没有科学合理的选择其正确的使用，出现任意搭配混用直接影响出苗及苗后药害影响生长。
田间土壤封闭时除草剂过量，会严重影响出苗；对早春倒春寒频繁地区、偏潮湿地块使用禾耐斯除草剂，土壤处理不当会影响出苗；喷洒除草剂后机械作业时耙耱不当，会把带药液的表土相对堆积而造成药害影响出苗。
四、如何解决出苗的因素
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