甜瓜全生育期均能发病，主要危害叶片，也可危害茎蔓及果实。开始在叶片上出现水渍状小点，逐渐扩大，受叶脉限制呈多角形或不规则形，有时叶背病部溢出黄白色液体，后期病叶变黄褐色干枯。病斑变脆而易开裂脱落。茎蔓、果实上的病斑初呈水渍状、凹陷，并带有大量粘液，果实表面病斑处易溃烂，裂口并向内扩展一直达种子上，致种子带菌。普通甜瓜、哈密瓜果斑病在叶片上的症状与黄瓜性角斑病在黄瓜叶片上的症状相近，但该病侵染叶脉，并沿叶脉扩展。
甜瓜性果斑病症状
叶片上病斑呈圆形至多角形，边缘初呈V字形水渍状，后中间变薄，病斑干枯。病斑背面溢有白色菌脓，干后呈一薄层，且发亮。严重时多个病斑融合成大斑，颜色变深，多呈褐色至黑褐色。果实染病，先在果实朝上的表皮上现水渍状小斑点，渐变褐，稍凹陷，后期多龟裂，褐色。初发病时仅局限在果皮上，进入发病中期后，病菌可单独或随同腐生菌向果肉扩展，使果肉变成水渍状腐烂。
甜瓜性果斑病病因
甜瓜性果斑病的病原在种子、土表越冬，可通过风雨、昆虫、农事操作传播，从伤口和气孔侵染。带菌种子萌发后，病菌从子叶侵入，引起幼苗发病。同时，病原还会侵染西葫芦、南瓜、西瓜、黄瓜等作物。棚内高温、高湿易发病。值得注意的是，该病的病原侵染果实时，在甜瓜坐果后1-3周的幼果期通过果皮上的皮孔侵入。一旦幼瓜开始转色、果皮表面形成蜡粉，则大多数皮孔封闭，能有效阻止继续侵入。所以，果实表现发病症状时已转色、近成熟，而病原菌却早已在幼瓜期侵入。因此，如果要等到甜瓜表现发病症状时再施药防治，就太晚了。
甜瓜性果斑病防治方法
首先，做好种子。可用50℃温水浸种3小时，捞出晾干后催芽，或10%磷酸三钠浸种20分钟后清水冲洗。注意掌握药剂浓度和浸种时间，避免影响种子发芽率。另外，小育苗厂可能操作不规范，幼苗也可能带毒，建议菜农从正规育苗厂育苗。
其次，做好土壤。建议轮作。定植前将棚内杂草，深翻地。定植时先对棚内进行，移栽时用DT600倍液进行浇穴或灌根。
建议起垄栽培、合理浇水，防止大水漫灌，注意通风排湿，缩短植株表面结露时间，在露水干后进行农事操作，及时防治棚室害虫。及时将病株带出棚外。子叶上病害多，应及时处理。可在甜瓜两叶一心时，选择晴好天气下用后的剪刀将子叶剪去。注意不能用手撕摘，并将子叶带出棚外。
再次，建议用塑料袋套袋处理。待甜瓜长到鹅蛋大时套装下端开口的塑料袋，4-6天后及时摘除。此时甜瓜表皮逐渐老化并形成蜡层，足可抵御病菌侵袭。
，药剂防治。甜瓜开花时，每10-15天喷洒一次百菌清或阿米西达混加中生菌素或宁南霉素，预防各种病害，尤其性病害发生。或喷用2000倍的链霉素预防，或选用47%加瑞农可湿性粉剂1000倍液，或50%可杀得可湿性粉剂1000倍液，或27.12%铜高尚1000倍液，或30%王铜1000倍液喷洒，或50%琥胶肥酸铜（DT）剂1000倍液，隔10天一次。注意，甜瓜幼瓜对铜制剂相对敏感，所以一定要将铜制剂浓度稀释一半使用，一方面仍防治效果，另一方面也不影响幼瓜生长。