芹菜菌核病主要为害植株的茎、叶片。先在叶片开始发病，叶片初始产生淡黄色水渍状斑，湿度大时形成软腐，并产生一层厚密的白色絮状菌丝体，后形成黑色鼠粪状菌核，条件适宜时可蔓延至叶柄及茎。
茎染病，症状和叶片染病大同小异，只是不同的是田间湿度大时，密生白色絮状菌丝体后，病茎组织软腐，后形成圆形或者不规则形黑色鼠粪状菌核。菌核早期白色，以后外部变为黑色，内部白色。病菌喜温暖潮湿的环境，适宜发病环境为温度15—25℃、相对湿度高于90%;适宜感病生育期为植株生长中、后期。
秋季以及冬季低温、寒流早、多雾霾的年份发病重。田块间连作地、地势低洼、排水不良的发病较重；种植过密、通风透光差，因寒流作物受冻、氮肥施用过多的田块发病重。
棚栽芹菜菌核病防治方法：
1.农业防治：播种前筛去菌核，或用10%食盐水漂种，汰核并用清水洗净后播种。发病地块及时拔除田间病株，收获后病残体，并带出田外深埋或烧毁，深耕土壤，加速病残体的腐烂分解，减少田间病原菌。
2.防治：用40%施佳乐悬浮剂1000倍或43%好力克悬浮剂4000——6000倍或50%扑海因可湿性粉剂1000倍或50%速克灵可湿性粉剂1000倍或25%好速净可湿性粉剂600——800倍或50%农利灵可湿性粉剂1000倍或40%菌核净可湿性粉剂700倍或50%乙烯菌核净干悬剂1000倍等防治。在发病初期开始喷药每7——10天喷一次，连喷2——3次。
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