芫荽菌核病主要为害茎，从茎基部开始出现水渍状软腐，致幼苗折倒枯死；成株能支撑几天。如此严重的后果，大家一定要注意防治。
防治方法
（1）实行3年轮作。
（2）从无病株上选留种子或播前用10%盐水选种，除去菌核后再用清水冲洗干净，晾干播种。
（3）适度密植，及时拔除杂草。
（4）设法降低棚内或田间湿度，发现病株及时拔除，携出田外集中烧毁，以减少菌核形成。收获后及时深翻或灌水浸泡或闭棚7-10天，利用高温杀灭表层菌核。
（5）采用地膜覆盖，阻挡子囊盘出土，减轻发病。
（6）采用生态防治法避免发病条件出现。
（7）发病初期开始喷洒5%速克灵或50%扑海因或50%农利灵可湿性粉剂1000-1500倍液或70%甲基硫菌灵可湿性粉剂600倍液、50%多菌灵可湿性粉剂500倍液、60%防霉宝超微粉600倍液、20%甲基立枯磷乳油l000倍液，667m2喷对好的药液60L，隔8-9天1次，连续防治3-4次。
（8）棚、室栽植芜萎使用15%腐霉利（速克灵）烟剂或45%百菌清烟剂，每667m2 250g，熏1夜，隔8-10天1次，连续或与其它方法交替防治3-4次。如喷撒5%百菌清粉尘剂，每667m2 lkg.采收前7天停止用药。
实行轮作，同时定期对土壤进行消毒杀菌，用护树大将军喷施消毒，可减少细菌滋生。同时选用无病种子或用新高脂膜拌种减少病害种子。扣棚后喷施1000倍“菌核净”1次，10天后再喷1次，立春前后喷第3次，以后每7~9天喷1次。并且注意生长期要加强放风，降低湿度以减轻病害发生。
病地实行轮作，或进行土壤消毒，用4%五氯硝基苯，每667平方米用量1公斤加细土50公斤，拌匀后施入土壤中。
用无病种子或药剂拌种。
扣棚后喷施1000倍“菌核净”1次，10天后再喷1次，以后每7-9天喷1次。
生态防治，整个生长期要加强放风，降低湿度以减轻病害发生。