引起烟草病虫产生抗药性的原因，除了病原菌、害虫等本身具备的产生抗药性的内因外，更为重要的是由于施用药剂对病虫害的选择压力，使具有抗性基因的个体得以一再增加累积的结果，是长期大量施用农药特别是化学农药直接导致了病原菌及害虫抗药性的产生。要预防烟草病虫抗药性的发生或延缓抗药性的发展，也必须从农药的种类、使用技术等可操作的影响因子入手。
（1）加强病虫害对各类药剂的敏感性监测，明确其抗性谱及抗性水平，以便适时更换农药品种以及合理搭配农药种类。
（2）加强病虫害的生物防治，实行病虫害的综合治理。尽可能的运用农业防治、生物防治、物理防治等其它的防治措施与化学防治的综合运用，不能将农药防治作为烟草病虫害防治的惟一措施。
（3）适当放宽病虫害的防治指标，从而降低了对病虫的选择压力，减少了用药次数及用药量，降低了抗性个体频率上升的速度，延缓了抗药性的发展。
（4）药剂种类、品种的合理轮换，特别是使用无交互抗性、作用机制不同的药剂进行轮换，可有效防止病虫抗药性的发生，减缓抗性的发展。不同机制的药剂在不同时间及空间的轮换，是目前病虫害抗性治理中采用广泛的策略。
（5）合理的农药施用方法及的施药时期。采用合理农药施用技术可有效的防止与延缓烟草病虫害抗药性发展，如采用棋盘式交替用药、镶嵌式用药、隐蔽施药等方式进行病虫害防治，在病虫害对药剂敏感的时期进行施药防治，使用增效剂以及合理的农药混用等。