西葫芦软腐病发生，病菌多从伤口处侵染，初期呈水渍状灰白色坏死斑，继而软化腐烂，散发出臭味。此病发生后病势发展迅速，瓜条染病后在很短时期内即全部腐烂。染病后空气干燥或条件对病菌极端不利时病部逐渐变褐并失水萎缩。叶柄受害病部呈黄褐色，后期病部缢缩倒伏。根茎部受害，髓组织溃烂，湿度大时，溃烂处流出灰褐色黏稠状物，轻碰病株即倒折。
田间识别：幼瓜、成瓜均可发病，病部变褐水烂。病势防治迅速，整个病瓜腐烂，有臭味。
发病原因：病菌在土壤中越冬。借雨水、灌溉水及昆虫传播。只能由伤口浸入。高温、高湿易发病，冬雨或田间有积水，常加重病势发展。
防治要点：
（1）高畦覆膜栽培。
（2）合理施用氮肥；增施磷、钾肥；注意灌水，避免大水漫灌，雨后及时排水。
（3）加强其它病虫害的防治；合理整蔓，严防果实日的发生。
（4）发现病瓜及时摘除深埋，病瓜处撒石灰消毒。
（5）发病初期及时喷农用链霉素150ppm或70%敌克松1000倍液喷雾。
（6）选择适当的抗病品种。采用黑籽南瓜作砧木进行嫁接栽培，增强抗病性。
1、农业防治。选用抗病品种，目前适合保护地栽培的西葫芦品种有：早青一代、美国碧玉等。
采用黑子南瓜作砧木进行嫁接栽培，可使植株根系强大、耐低温、抗病性强。避免与白菜类蔬菜连作。
加大行距、缩小株距，以利于田间操作，避免人为造成植株伤害。同时要注意通风透光。
2、处理土壤连作地定植前15-20天，采用石灰氮（氰氨化钙）加有机肥（牛粪、鸡粪等）—太阳能闷棚土进行土壤消毒。
3、药剂防治定植时用77%多宁可湿性粉剂600倍液灌根，返苗后灌第二次，隔7天一次连灌2-3次。细菌性茎基软腐病和枯萎病混发时，可向茎基部喷灌60%百泰水分散粒剂1500倍液或70%甲基硫菌灵可湿性粉剂1000倍液，可兼治二种病害。
除继续用同上药灌根外，①涂抹：70%甲基硫菌灵可湿性粉剂+3%克菌康可湿性粉剂+50%琥胶肥酸铜可湿性粉剂（1:1:1）配成100-150倍稀粥状药液，涂抹水渍状病斑及病斑的四周。②喷雾：用3%克菌康可湿性粉剂800倍加50%根茎保2号可湿性粉剂800倍或56%靠山水分散微颗粒剂800倍，隔5-7天喷一次。