1、荸荠秆枯病
荸荠秆枯病是危害荸荠很重的一种病害，发病秆率一般达20％～50％，严重的达100％。病菌主要危害叶鞘和叶状茎，初产生暗绿色水渍状病斑，接着形成绿豆大小的灰黑色病斑，梭形，椭圆形或不规则形。在高湿情况下，病斑上生灰色霉层，即分生孢子。然后病斑继续扩大，纵向扩展远大于横向，形成枯黄色长条形大斑，病斑横向绕叶状茎一圈，引起整个叶状茎枯死。
该病原为黑盘孢目荸荠柱盘孢菌。该病菌以分生孢子在病残体及球茎上越冬，因此老产区连作可加重发病，新产区则以带菌种球为初侵染源，经雨水传播。该病的流行和大面积发生主要发生在荸荠5月份育苗期间和移栽大田后的8～10月份，以9～10月份发病重。此期间荸荠生长茂密，气温较低，再加上阴雨天气，造成密闭、高湿的环境，使得病害极易发生和蔓延。
防治措施：A.实行3年以上轮作，进行水旱轮作；B.选用无病种球作种，育苗前对种球进行消毒，具体做法见育苗一节；C.清洁田园，销毁田间病残体，减少来年初侵染源；D.生长旺盛期，及时拔除过密的病弱苗，以利于通风透光；E.药剂防治：于8月下旬施药，以后每隔7～10天1次，到10月下旬止；如遇风雨，雨止后应及时喷药保护。药剂为50％果病克1500g/hm2或粉霉灵1500g/hm2，对水750kg喷雾。
2、荸荠枯萎病
荸荠枯萎病俗称“荸荠瘟”，是一种毁灭性病害，从播种至收获皆可为害，致荸荠烂芽、枯苗和球茎腐烂，尤以成株期受害重。苗期或成株染病茎基部初变褐，植株生长衰弱、矮化、变黄，似缺肥状，以后少数分蘖开始枯萎，终至全株枯死；根及茎部染病变黑褐色软腐，植株枯死或倒伏，局部可见粉红色粘稠物，即病菌分生孢子座和分生孢子；球茎染病变黑褐腐烂。
荸荠病原为尖镰孢菌荸荠专化型，属半知菌类真菌。病菌以菌丝潜伏在荸荠球茎上越冬，并可随球茎作为蔬菜或种球的调运进行远距离传播。
防治措施：①首先明确该病的分布，对疫区进行封锁；②严禁带病球茎或种球向外调运；③对带病种球进行消毒，具体做法见育苗一节；④药剂防治：6月中旬施用50％甲基硫菌灵·硫磺悬浮剂600～700倍液或70％代森锰锌干悬粉500倍液喷雾1次，间隔期10天。
一、病原物病害
1、荸荠秆枯病：该病俗称“荸荠瘟”，广泛分布于荸荠产区，植株感病后地下茎不结荠或结小荠。初生病斑暗绿色水渍状，不规则形或近圆形，略凹陷，以后病斑呈暗绿至灰褐色，梭形或椭圆形，上生黑褐色小点。小病斑扩展连合成不规则的大病斑后，可造成茎秆枯死倒伏，呈浅黄色稻草状。早晨露水未干或湿度大时，病斑表面可见大量浅灰色霉层。病原分生孢子可进行再侵染危害。此病一般在8月中旬开始发病，发病高峰为9月中、下旬，田间湿度大有利于该病发生。
2、荸荠枯萎病：该病是荸荠主要病害之一，整个生长季节均可发病，尤以9月中旬至10月严重。其症状有青枯型和枯斑型。⑴青枯型表现为从秆端或一侧失水呈青枯状，并向下扩展，整秆枯死，尤其在雨后天晴时，其症状在田间为明显。病株一般不结荠或结白荠，危害较大。⑵枯斑型一般比青枯病型发病迟，一般在9月下旬以后。表现症状：马蹄秆中上部呈现灰白色枯斑，病健分界十分明显，略凹陷，病斑间可相互连合成大斑。病株发育一般较正常，危害较小。
3、荸荠蹄茎腐病：该病一般在9月份盛发，发病的叶状茎外观症状为枯黄至褐黄色，病茎较短而细，发病部位多数在叶状茎的中下部、病部初呈暗灰色，后为暗色不规则病斑，病健分界不明显，且病部组织变软易折断，湿度大时，病部可产生暗色稀疏霉层。
二、生理性病害
通常表现为生理性红尾，其症状主要是红尾不干苗或只在顶端的一小节茎秆上干枯。该病多发生在8―9月初，产生的原因是多年种植荸荠的土壤缺少硼、锌、铁、锰等微量元素。
三、虫害的识别
白禾螟（又称白螟）：是危害荸荠的主要害虫，幼虫咬食茎秆基部，被害初期，荸荠茎秆顶端由绿转黄，茎秆上能找到虫孔，剖开茎秆可见内有虫道、虫粪及灰白色幼虫。若蛀入茎秆的幼虫多或虫龄大，则数天内茎秆由上至下黄化枯死，呈桔黄色，但不像病害那样有病斑或青枯。茎秆转黄枯死后，幼虫转移危害。
四、综合防治
1、病原物病害的防治：⑴预防为主。每亩用细硫磺粉4―5公斤+50%多菌灵0.5公斤+75%敌克松可湿性粉剂0.5公斤分别结合施肥或单独与细泥或细砂15―20公斤配成菌土，在8月中旬、9月中旬各施一次，对预防上述三种病原物病害的发生都有良好的效果。⑵种植田块应采取轮作。田块宜小，大块田应分隔成适当小块，分开排灌，杜绝串灌、漫灌，以防病菌随流水扩散。⑶适期喷药防治。在生长期间随时检查，发现病株及时防治。秆枯病或枯萎病可用50%多菌灵600倍液+70%甲基硫菌灵800倍液+100万单位兽用硫酸链霉素12500倍液或12.5%敌力康2000倍液喷施；茎腐病可用40%五氯硝基苯粉剂500―600倍液喷洒。每隔7―10天喷一次，连喷3―4次，也可视病情轻重增减施药次数。
2、生理性病害的防治：每亩撒施硼砂、硫酸锌各2公斤，叶面喷施“十元素硼肥”100克+磷酸二氢钾150克对水50―60公斤喷茎叶，每隔5―7天喷1次，连喷2―3次即可。
3、常见虫害的防治：白螟主要是以第三、第四代幼虫危害荸荠，发生期在8月上旬至9月下旬，世代重叠严重，难以喷药防治，必须采取上喷下闷的办法才能奏效。具体措施：在成虫盛发期每亩用进口呋喃丹3―4公斤或米尔乐1.5―2公斤或20%甲基异柳磷乳油0.4公斤+20%三唑磷乳油0.4公斤与细泥或细砂15―20公斤拌成毒土撒施。同时在第三、四代白螟孵化高峰后1―2天，用18%杀虫双水剂300―400倍液+90%晶体敌百虫800倍液或20%三唑磷乳油500―600倍液+20%甲基异柳磷乳油500―600倍液喷雾防治。