苹果树病害防治打药不在次数多，关键要打得巧，即要把药用在防治病害的关键时期。要做到这一点，必须了解生产中主要病害的发生规律，然后根据发生规律，在病害敏感的时期提前用药，把病菌控制在未萌发或未侵染状态，达到事半功倍效果。
褐斑病
以菌丝块或分生孢子盘在落叶上越冬，第二年春季4～5月份多雨时产生大量分生孢子（干燥及沤烂的病叶无产生分生孢子能力），并通过雨水飞溅侵染近地面的叶片，5～6月份遇高温高湿开始发病，7～8月份大量发病，10月份气温降低后停止危害，潜伏期13～55天。
斑点落叶病
以菌丝在受害叶片、枝条和芽鳞中越冬，第二年春季产生分生孢子，随气流、风雨传播，花后7～10天开始侵染，5～6月和8月份遇高温大量发病。受害叶片病菌孢子形成在4月下旬至5月上旬，枝条上形成在7月份。
轮纹病
又叫粗皮病、轮纹褐腐病。主要为害枝干和果实。该菌以菌丝体在枝干病瘤内越冬，第二年3～4月随雨水传播先侵染枝干，后侵染果实。6～7月份侵染幼果，但不发病。当果实在近成熟期遇高温干旱则发病较重。发病高峰在采收前到贮藏后1个月。枝干病以皮孔为中心形成扁圆形红褐色病斑，中心突起呈瘤状物，病部边缘龟裂，第二年中间产生黑色小粒点。果实感病以皮孔为中心生成水渍状淡褐色小圆点（红点），扩大后形成浅、深褐色相间的同心轮纹，并有茶褐色粘液溢出，全果很快腐烂，发出酸臭味。生长前期雨水多发病早，成熟期高温干旱发病重，反之则轻。
炭疽病
主要危害果实。病菌以菌丝体在僵果、果苔、干枯枝及枝条破伤处等部位越冬，第二年分生孢子借雨水和昆虫传播，经皮孔侵入果实发病，并多次侵染。一般5月下旬至6月上旬进入侵染盛期，7～8月高温高湿为发病盛期，病果大量出现。果实发病后，初为褐色小圆斑，后变为深褐色（或黑色）病斑并下陷，中心突起黑色小粒点呈同心轮纹状排列。高温、高湿、多雨时严重发生。果园密闭低洼，通风透光不良易发病。
总之，预防病害要抓住三个关键时期：一是冬、春季的清园工作，破坏病菌越冬场所，减少病菌越冬基数。二是花后3～5天至果实套袋前加强保护，防止病菌侵染。三是注意气候变化，做到雨前喷药，防止病菌扩散侵染。
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波尔多液和石硫合剂不可混用。因为这两种农药混用后会发生化学变化，生成多硫化铜，不仅降低药效，而且会造成药害。先后使用这两种农药时，也要间隔一定时间。先用石硫合剂，需间隔20至25天后可喷用波尔多液；先喷用浓尔多液，需间隔25至30天才可使用石硫合剂。
波尔多液和石硫合剂与多数杀虫剂，如辛硫磷、三硫磷、磷胺、敌敌畏、三氯杀螨醇、克螨特、西维因等均不可混用，混用后则导致药剂分解而失效。微生物杀虫剂，如白僵菌、青虫菌，不可与微生物杀菌剂，如井岗霉素、春雷霉素混用，否则微生物会被杀伤而降低药效。
油乳剂、皂液与多数杀虫、杀菌剂不可混用，混用则会造成药剂分解或沉淀而降低药效。有机磷农药与溴氰菊酯混用，虽能增加杀虫效果，但也能增加对人的毒性。。