施肥是龙眼树管理的主要内容，是实现稳产增产、克服大小年结果现象的基本措施。根据龙眼树生长情况，进行科学施肥。
龙眼三时期施肥促高产
1.重施花前肥
花前施肥，主要起到保花的作用。于12月底至2月上旬前施，以复合肥为主。施肥时期根据树势、叶色深浅及雨水等情况确定，如果树势较旺一般不宜早期施肥，反之树势衰弱或天气较冷则要早期施肥。
2.壮花壮果肥
六到七月是龙眼果实生长迅速时期，应该及时补充开花后期树体的营养。在开花前、幼果期、果实膨大期喷施“壮果蒂灵”，使花柄、果柄增粗，加大花果期的养分供应，果实生长发育所需要的营养，保花保果，起到壮花壮果的作用。
3.采后施基肥
果实采收结束后，树体营养水平较低，树势较弱，采果后及时补充树体营养，强健树势，积累养分，促进成花。基肥以有机肥为主，如圈粪、堆粪、绿肥、作物秸秆等，若再加入适量性氮肥和磷肥，效果更好。