稻种传病害种类多，尤其水稻恶苗病在机插稻和旱育移（抛）栽稻上发病较重，干尖线虫病的发生区域也在扩大，苗稻瘟、稻蓟马等病虫在沿海、沿江的部分地区苗期发生普遍，对水稻齐苗壮苗构成较大威胁。那么水稻种子怎么处理，才能防治这些危害呢？
精选稻种，打好壮苗基础
要因地制宜选用优质抗病良种，精选无病健壮稻种，在药剂处理前晾晒2-3天，并进行风选，通过去杂去劣，减少菌源并增加种子活力，提高发芽率、发芽势。近年恶苗病、干尖线虫病、稻瘟病、细菌性条斑病等病害重发地区，要压缩高感品种的种植，降低病害发生的风险，减轻防治压力。
正确开展药剂处理，提升种子药剂处理质量
1、选准药种
对恶苗病，可选用氰烯菌酯、咯菌腈、精甲咯菌腈、甲嘧甲霜灵、乙蒜素、氟环咯精甲等药剂浸种或拌种，鉴于我省绝大部分地区恶苗病菌已对咪鲜胺产生高水平抗性，要停用咪鲜胺浸种；对干尖线虫病，可选用杀螟丹及其复配剂浸种；对恶苗病与干尖线虫病混发区，可选用杀螟乙蒜素、杀螟丹加氰烯菌酯等药剂浸种或拌种。
生产上可选用25%氰烯菌酯悬浮剂2000-3000倍液，或17%杀螟乙蒜素可湿性粉剂200-400倍液浸种；或62.5克/升精甲霜灵咯菌腈悬浮种衣剂300毫升，加水1700毫升，搅拌包衣稻种100千克；或12%甲嘧甲霜灵悬浮种衣剂250-500毫升，加水稀释至1-2升，搅拌包衣稻种100千克。
或31.9%吡虫戊唑醇悬浮种衣剂300-900毫升，加水稀释至2-3升，搅拌包衣稻种100千克；对灰飞虱、稻蓟马发生较重地区，可用吡虫啉、噻虫嗪、噻虫胺等药剂浸种或拌种，如针对稻蓟马，可用30%噻虫嗪悬浮种衣剂100-300毫升，加水1-2.5升稀释后搅拌包衣100千克稻种。
或水稻种子先浸种催芽至露白，再600克/升吡虫啉悬浮种衣剂200-400毫升稀释后搅拌包衣100千克稻种；对细菌性条斑病、白叶枯病等细菌性病害发生区，示范应用三氯异氰尿酸、氯溴异氰尿酸浸种或噻唑锌拌种；对稻瘟病重发地区及其感病品种，示范应用异噻菌胺肟菌酯包衣。
2、提高种子处理质量
要根据农药标签要求，用准种子处理的药剂浓度，不可盲目加大或降低浓度，防治效果；药剂浸种时间要在48-60小时，浸后不用淘洗，直接播种或催短芽播种；要注意浸匀浸透，浸种时药液要淹没稻种；袋装化浸种时稻种装满2/3袋，确保翻袋时种子吸足水后均匀受药，并时常翻动种子，提高浸种效果。
机插稻分批浸种时切忌废液再利用，以防药剂浓度下降和病菌污染降低防效。包衣时要将种子与调好的药液充分混匀，确保种子均匀着药，晾干后催芽播种或晾干后直接播种；要大力示范推广专用器械拌种（包衣），提高种子处理质量。
3、调节浸种期间温度
塑盘集中育秧要适当降低育秧期间温度，降低长芽阶段病菌的侵染风险；旱育秧田催芽时禁用稻草垫底或覆盖，以防稻草带菌再侵染；避免高温催芽和催长芽。残留药液不能倒在桑园、鱼塘以及蚕室旁，以免鱼类、鸟类和家蚕中毒，药液浸过的种子不可食用或作饲料。
4、种子消毒：50%氯溴异氰尿酸可溶性粉剂100克对水100-120升水，浸种60-80公斤，48小时即可起到作用，如果促进出芽齐、快可以同时加入30-40毫升0.1%三十烷醇微乳剂；咪唑喹啉铜33.5%水悬浮剂100毫升，对水100-120升，可浸泡60-80公斤种子，同时亦可加入0.1%三十烷醇微乳剂30-40毫升。
也可以通过0.25%戊唑醇悬浮种衣剂500毫升25公斤种子进行包衣处理。杀灭附着在种子颖壳上的恶苗病病菌及细菌性褐斑病病菌。