1、不良天气
芒果在花芽分化时需一定的低温，才能刺激它的生长，而如果在花芽分化时遇连续高温时会造成其抽穗困难。另外虽然一时的低温能促进其花芽分化，但是低温阴雨气候也不利它的坐果，在开花后如果出现低温阴雨气候就会造成落花、授粉不良、坐果率低的现象。所以要做好修剪以及疏花疏果光照，促进花芽分化，提高坐果率。
2、营养不足
施肥不足，土壤的养分较少，使得果树生长不良，影响到产量和品质，尤其是在花果期时，由于营养生长期短，所以树体的营养累积较少。很多果农在种植时缺肥比较严重，在生长期时又不施肥，会导致果树开花结果较少，在后期因为营养不足就会造成大量的落花落果现象。在芒果花果期营养需求较大，要及时施肥补充营养，在花萌芽期，及时施壮花肥，促进花穗发育，花谢后，追施壮果肥，促进果实发育。
3、生理代谢失调
在生产中，很多果园会喷施多效唑催花，但是由于催花配套栽培技术应用少、长期用药过量等原因，会到树体生理代谢失调，从而出现花穗较差，雌雄花比例不合理的现象，导致坐果率低，落花落果现象较严重。在花芽分化时可以定期喷洒植物营养液，提高叶片的光合作用，降低农药残留，促进茎叶对于肥料的吸收利用，树体健康生长。
4、病虫害危害
随着气温升高，花果期时病虫害的高峰时期，这时的病害有炭疽病、白粉病、煤烟病、细菌性角斑病等，虫害有夜蛾、短头叶蝉、蚜虫、蓟马等。它们都会影响到芒果的产量和品质，所以要做好病虫害的防治工作，发生病虫害及时防治。