修剪工作是芒果速生、早结果、丰产稳产、优质的关键措施之一。无论整形或修剪，都必须与施肥和病虫害防治紧密结合才能取得预期效果。对于修剪时造成的伤口涂抹油质软固体“愈伤防腐膜”保护，防病虫侵染和伤口干裂，促进愈伤组织快速生长愈合。
1、花芽分化前修剪 疏除过密枝、阴弱枝，病虫枝、交叉、重叠和徒长枝，增加树冠透光度，促进花芽分化。对生长过旺、多年不结果的植株通过环割（环割后涂抹“促花王2号”）、扎铁丝及断根等方法抑制植株生长，促进花芽分化。
2、在第二次生理落果后（约3-4月）剪除影响果实发育的花梗与枝条，疏除畸形果，病虫果及过小的败育果；对未结果或开花不结果的枝条可酌情短截，促进抽梢，培养来年的结果母枝，也可增加树冠的透光度。
3、采果后修剪这是重点修剪时期，采果后及时短截结果枝至该次梢的基部2-3节。对树冠中的病虫枝、过密、交叉、重叠枝和阴弱枝予以疏除，对因多年结果而衰竭的枝条和徒长枝一般应予剪除，但如位置适宜，或树冠衰弱，也可短截更新，复壮树冠。
芒果是一种较耐修剪的果树。芒果结果树的修剪方法和强度，应按照品种、树龄、树势、种植密度、立地条件和平共处管理水平等方面的不同而有所区别，例如通过修剪，可迫使桂香芒松散的树形趋于紧凑，使紫花芒密集的枝条得到合理的伸展。芒果树的修剪按时间可分为春季修剪和秋季修剪。
1、春季修剪
为了调节营养生长与生殖生长这间的平衡，有利于均衡生产和提高果品质量，应控制花穗量。在抽穗至开花期间进行疏花，疏去过多的花穗，一般使花穗在末级梢上抽生占70%即足够，其余30%应使之抽生春梢，有一定的营养生长量。如花穗过长，应疏除部分小花枝，保留1/2～2/3的花量已足够。
如果幼果期坐果太多，应及早把部分小果疏去，每穗仅留5～6个发育较好的小果观察，以待日后稍大时再决定去留。同时，应及时剪除空怀的花枝、病弱枝，防止果实与之碰撞磨擦，影响果实的外观。
挂果偏少的幼龄结果树往往会抽生夏梢，对养分的竞争会引起大量落果，严重影响本来已少的结果量。因此，为了果实的正常发育，在夏梢萌发3～5厘米时应进行抹梢。
2、秋季修剪
芒果的秋季修剪一般在采果后进行，所以又称采后修剪。这次修剪有促进秋梢抽生的作用。采果后要求少要培育两次秋梢的抽生，末次梢的抽生不应迟于11月上旬，因此，秋季修剪应力争在8月底9月初完成。
修剪的对象是密枝、郁闭枝、多余枝、错乱枝、下垂枝、重叠枝、交叉枝、病虫枝等。修剪的方法是首先除去过密过多的主枝，调整骨干枝的部位和数量，然后再剪除上述对象枝条，按照不同品种和对树形的要求，对长枝进行回缩、短截，并将外围结过果的残枝，在其下密节处短截。
芒查修剪的原则：按树定型，抑上促下，疏松均衡，上重下轻。结果树的秋季修剪要注意在修剪前后必须结合重施肥料，营养生长所需的无机养分供应，迅速恢复树势及生理机能，积累养分进行花芽分化，为来年生产打下基础。同时，在修剪过程中，除因树体更新需要之个，一般修剪不宜太重。