在番茄发生软腐病严重时可以使用以下农药进行防治：
喷洒23%络氨铜水剂500倍液、50%琥胶肥酸铜可湿性粉斑500倍液、72%农用硫酸链霉素可湿性粉剂4000倍液、77%可杀得可湿性粉剂500倍液，7～10天喷1次，可喷1～2次。
1、加强田间管理，整枝抹芽宜早。结果期间防治蛀果害虫。
2、合理轮作：和非茄科作物进行三年以上轮作，以降低土壤中菌源基数。
3、选用抗病品种，严把育苗关；市场上推广的品种中高抗叶霉病的有佳粉15、佳粉16、佳粉17、中杂7号、沈粉3号、佳红15等，可因地制宜，选用种植。
4、种子消毒：引进种子需要进行种子处理，采用温水浸种，利用种子与病菌耐热力的差异，选择既能杀死种子内外病菌，又不损伤种子生命力的温度进行消毒。对于温室栽培的番茄种子宜选择用55℃温水浸种30分钟，以种子内外的病菌，取出后在冷水中冷却，用高锰酸钾浸种30分钟，取出种子后用清水漂洗几次，晒干催芽播种。
红柿软腐病主要是从果实转红期开始发病，很少危害到青果。主要侵染的两部分是茎干和果实。及时进行农药防治才能避免造成经济损失。随小编一起了解防治要点：
西红柿软腐病一般在夏秋湿度大时发病严重，露天西红柿发病重于温室栽培。
1、侵染茎干。可以造成茎干腐烂，内部中空变褐，能够造成植株死亡，危害比较严重，经常从摘果、掐叶、整枝的伤口开始入侵。
例如，植株打叉过晚，造成的伤口过大，细菌容易侵染；在阴雨天或者露水未干的时候进行田间操作，细菌容易侵染伤口。
2、侵染果实。如果果实施肥或者其他管理不科学，造成果实皴皮、裂果，细菌容易侵染，导致果实内部水烂，有臭味，但是果皮保持良好。
西红柿软腐病防治方法：
1、尽量减少果实以及茎干伤口，防止细菌侵染。在果实膨果盛期，可以叶面喷施硼钙叶面肥，防止果实裂果或者皴皮。
2、及时将病原体（病果、枝叶）清处棚外，因为细菌可以在土壤中残留，随着灌溉水等传播。
3、农药厂家建议在叶面喷施细菌药剂，例如中生菌素、叶枯唑、喹啉铜等药剂。
番茄软腐病主要为害果实和茎。果实染病，果皮虽保持完整，但内部果肉腐烂，具恶臭；茎部染病多始于整枝、打杈造成的伤口，严重的髓部腐烂，失水后病组织干缩中空，病茎上端枝叶萎蔫，叶色变黄。
发生规律病菌随病残体在土壤中越冬。借雨水、灌溉水及昆虫传播，由伤口侵入。茎部染病主要是在一些整枝过晚的植株，因枝条过粗，造成的伤口大，难于愈合，易于病菌侵入。病菌生长发育适温25-30℃，40℃，2℃，在50℃下经10min致死。除侵染番茄外，还侵染十字花科、茄科蔬菜、芹菜、莴苣等多种蔬菜。阴雨天或露水未干时整枝打杈，或被棉铃虫蛀过的果实发病重。
防治方法
（1）早整枝、打杈，避免阴雨天或露水未干之前整枝。
（2）及时防治蛀果害虫，减少虫伤。
（3）必要时喷洒72%农用硫酸链霉素可溶性粉剂4000倍液、77%可杀得可湿性微粒粉剂500倍液、25%络氨铜水剂500倍液，或50%琥胶酸铜可湿性粉剂500倍液