在棉花红叶茎枯病的防治上，主要应抓好以下几点。
一，控上促下，增强抗逆能力。一是对长势较旺的棉花，应用植物生长延缓剂缩节安或助壮素控旺，每亩用缩节安2~3克或助壮素8~12毫升，个别近于疯长的棉花，在打顶后每亩缩节安和助壮素的用量可追加到4~5克或16~20毫升，兑水50公斤喷雾，能有效地协调棉株体内养分平衡，并能促其稳长；二是对土壤板结的棉田，要及时中耕破板通气，增强通透性能；三是对地势较低的棉田，要随时注意疏理沟厢，促使棉根下扎；四是对实行双膜栽培的棉田，要快速揭除地膜，使其棉根向纵深发展。
二，增施钾肥，提高施肥效率。缺钾是诱发棉花红叶茎枯病的主导因子之一，对于土壤潜在性缺钾或施钾较少的两类棉田，每亩要增施钾肥10~15公斤，一可满足棉花对钾肥的需要，二可调整肥料配比结构，提高氮肥、磷肥的利用率。
三，根外喷肥，改善供氧吸肥环境。已发红叶茎枯病的棉花，只要棉叶尚未枯萎，主茎生长点保持鲜活的，可用根外追肥快速恢复生育功能。一是每亩用腐殖酸活性液肥惠满丰或庄福星100毫升，兑水50公斤喷施，既快速供肥，也可改善土壤供氧状况；二是可喷施0.01%天丰素或保靓溶液，可促其较快生长；三是喷施植物生长促进剂“802”4000~6000倍溶液，能加速细胞分裂，增强棉花自我调节能力。
1.精耕细作
平整土地，深翻改土，用地、养地相结合，增强土壤的保水、保肥能力。干旱地区要勤中耕以减少蒸发，促进棉株根系下扎和吸收土壤中的水分和养料，提高抗旱能力。
2.重施基肥、巧追肥
多用农家肥作基肥，有条件的地方可种植绿肥或实行麦棉轮作以补充有机肥的不足，达到改良土壤和培肥地力的目的，改变长期单一施用化肥的现状，以免破坏土壤团粒结构，降低保肥、保水能力；根据棉花各生育期的需肥规律，巧施追肥。一般轻施苗肥，酌情施蕾肥，重施花铃肥，补施盖顶肥；在追肥种类上要注意氮、磷、钾三要素的配合，其中钾肥尤为重要；在生育后期对已有早衰迹象的棉田，及早喷施旱地龙、磷酸二氢钾及尿素供叶片直接吸收利用，使其迅速发挥肥效，有明显的保叶增产效果。
3.合理排灌
棉花不同生育期对水分需要量不同，苗期、蕾期需要的少。而棉花花铃期对肥水的需求量较大，且又常与伏旱、高温季节不期而遇，故要及时灌水施肥，达到抗病增产的目的。在秋季多雨时要及时做好排水工作，防止渍涝引发的根系吸收和生长不良。
4.重施花铃肥
早熟品种或早播的棉田棉苗发育早，前期坐桃多且易遇干旱季节，因而常会出现“未老先衰”的现象，因此要及早施用且重施花铃肥，确保肥水后移，棉花稳健生长。从而达到减轻或不发生棉花红叶茎枯病的目的。