棉花在这种高温天气遭遇暴雨洗涤，有部分棉田的棉苗可能发生红叶茎枯病，轻者少数棉苗迅速萎蔫，重者成片棉苗急剧萎蔫垮杆。
棉花红叶茎枯病多从主茎生长点或果枝开始发病，一般由上向下、由外向内发展，叶尖、叶缘先呈失绿状，叶脉仍保持绿色，脉间叶肉呈淡黄色，渐转成红色，叶片翻卷继而枯死。叶柄失水，叶片逐渐脱落。主茎枯萎致死但解剖导管无异色。根系粗短，须根少发育不良。
棉花红叶茎枯病发病重有几种情况，一是棉田耕作粗放，棉根发育不良的发病重；二是排水不良的棉田发病重；三是偏施氮肥，棉花长势旺盛，棉田荫蔽大的发病重；四是有机肥少，地力差的田发病重。由此不难看出，当气候发生陡变时，一些栽培环境较差、生理机能发育不全的棉花就易发生红叶茎枯病。
该病发生与缺钾有关，但不同于单一的缺钾症，而是在缺钾的同时也缺磷、缺氮所致。其发生程度与土壤、施肥、品种的关系密切，一般发生较早且严重棉田，主要的诱发因素是:①多年重茬、保水保肥能力差的沙性土壤以及盐碱地、耕层过浅的棉田。②没有揭膜或者揭膜偏晚。③底肥没有使用钾肥或用量不足，使用磷素偏少，施用氮肥过多且化控失当的。④品种抗病性偏差导致植株生长不良，抵抗力减弱。⑤早熟品种又过早播种，前期结铃过多负载过重。⑥受旱严重或浇水偏晚。⑦地势低洼、排水不及时，会因棉花根系发育不良，棉株地下、地上部分生长失调而诱发该病。需要特别注意的是，该病发生的同时容易导致褐斑病、角斑病和枯、黄萎病等病害的相伴发生，潜在的危害更大。
该病为非侵染性病害，即属棉花的生理性病害，由多种非生物因素综合引起，肥、水、土壤、气候及耕作制度等环境条件与该病发生关系十分密切。
棉花现蕾期至盛花期期间的土壤水分和蕾铃脱落率分别是影响红叶茎枯病发病的主动因素和关键因素。
1、棉花中后期营养生长和生殖生长旺盛，对肥、水的需要量大，此期一旦肥、水不足，易造成该病害的发生。
2、长期干旱高温，土壤耕作层缺水，阻碍新陈代谢正常进行，以致生理失调，造成棉株“未老先衰”而发病重。
3、另外是由于棉花缺钾，导致红叶茎枯病；还有可能是由于红叶茎枯病棉株的铃叶比大，叶片向棉铃输送的钾素多，所以一般产生红叶茎枯病的棉叶它钾的含量偏低，这是长期以来将棉花铃叶比失调引发的继发症误认为是其原发性缺钾的原因。所以有时候缺钾只是红叶茎枯病表现的一种症状，就好比有些人它看着瘦弱，怎么吃都长不胖，很多时候我们就认为它可能是吃的不好，其实它可能吃了很多，但只是表现出来的是瘦弱的样子。
4、另外有些抗虫棉果枝节位低，现蕾开花早，前期结铃性强成铃率高，结桃集中，常因其生殖生长过早，而使营养生长受到抑制，因此易感红叶茎枯病。
5、还有一个值得注意的就是由于现阶段有些棉花长势比较旺盛，很多农户采取控水的方式来调节棉花的长势，旱的时间长，再猛浇水容易导致红叶茎枯病的发生。
就棉花来说，可以简单认为铃就是聚集大量营养物质的棉铃，而叶主要是叶子。早熟品种开花期早，铃叶比高，病害发生重，盛蕾期以前的气温对棉花生长和红叶茎枯病发生的作用大于土壤水分作用。盛蕾期以后土壤水分以及养分影响红叶茎枯病发作的主因。