芥菜得了软腐病主要的防治方法有：
（1）把好茬口关：将芥菜与禾本科作物进行轮作，避免十字花科作物连作。
（2）把好耕作关：一是整地要平，避免畦面出现高低不平；二是厢沟要深，要求沟的深度达到25～30cm（沟宽40cm）；三是畦面要高，要求畦面高度达到30cm以上。
（3）把好管水关：对芥菜的管水，应采取浇水的方法进行抗旱，避免大水串灌、漫灌而导致人为传播病害。
（4）把好施肥关：应采取配方施肥的办法，避免过量施用氮素肥料而人为诱发病害。
（5）把好除虫关：防好地下害虫、钻蛀性害虫、叶面害虫等三大类型的害虫，从而防止虫伤株、减少病原菌侵入机率，这是预防芥菜软腐病发生的重要措施之一。
（6）把好用药关：在芥菜发病初期用药是防病适期。
化学防治
（1）14%络氨铜水剂350倍液，隔10天1次，连续防治2～3次，还可兼治黑腐病、细菌性角斑病、黑斑病等。但对铜剂敏感的品种须慎用。
（2）种子药剂处理和喷淋。
方法有：
①用“丰灵”50～100克拌种，或采用农抗751，按种子量的1～1.5%拌种；
②苗期喷洒“丰灵”每亩100～150克，加水50升；
③用“丰灵”150～250克对水100升，沿菜根挖穴灌入，或在浇水时随水滴入农抗751，每亩2.5～5升。由于该病苗期侵染期长，侵染部位多，在间苗或二次定苗时再防1次，有利提高防效。
（3）喷洒硫酸链霉素或72%农用硫酸链霉素可溶性粉剂3000～4000倍液，或新植霉素4000倍液，隔10天1次，连续防治2～3次，还可兼治黑腐病、细菌性角斑病、黑斑病等。
农业防治
（1）尽可能选择前茬大麦、小麦、水稻、豆科植物的田块种植，避免与茄科、瓜类及其它十字花科蔬菜连作。（2）及早腾地、翻地，促进病残体腐烂分解。
（3）仔细平整土地，整治排灌系统，非干旱地区采用高畦直播，深沟高厢种植。
（4）实行沟灌或喷灌，严防大水漫灌。
（5）发病重的地区，选用抗软腐病的品种。（6）适期播种，大力推广带状种植，避免施肥打药等农事操作造成人为伤口。