玉米秸秆还田技术处理不当会出现出苗率低、苗黄、苗弱，甚至死苗现象，分析其原因主要有以下三个方面。
一、碳氮比失调。秸秆本身碳氮比为65～85∶1，而适宜微生物活动的碳氮比为25∶1，秸秆还田后土壤中氮素不足，使得微生物与作物争夺氮素，结果秸秆分解缓慢，麦苗因缺氮而黄化、苗弱，生长不良。解决办法：秸秆粉碎后，旋耕或耕地以前在粉碎的秸秆表面撒施氢铵50公斤或尿素20公斤，然后耕翻。
二、秸秆粉碎不符合要求。有的地块粉碎后的秸秆过长，其长度大于10厘米，不利于耕翻，影响播种。解决办法：使用大型秸秆粉碎机，因为大型秸秆粉碎机机器马力较大不仅粉碎的秸秆较碎，在旋耕时粉碎的秸秆与土壤搅和均匀，旋耕较深。
三、土壤大小孔隙比例不合理。秸秆还田后，使土壤变得过松，大孔隙过多，导致跑风，土壤与种子不能紧密接触，影响种子发芽生长，使小麦扎根不牢，甚至出现吊根。
那么，怎样才能弥补以上缺陷，稳产、高产呢？除采取以上有针对措施以外，还要注意以下几个方面：1、补施氮、磷、钾肥料。2、提高土壤墒情。 3、提高播种质量。秸秆还田的地块，以提高播种质量。4、适时镇压浇水。小麦播种后，晾晒一天，用石磙镇压，使土壤密实，消除大孔洞，大小孔隙比例合理，种子与土壤紧密接触，利于发芽扎根，可避免小麦吊根现象。
一、碳氮比失调。秸秆本身碳氮比为６５～８５∶１，而适宜微生物活动的碳氮比为２5∶1，秸秆还田后土壤中氮素不足，使得微生物与作物争夺氮素，结果秸秆分解缓慢，麦苗因缺氮而黄化、苗弱，生长不良。
二、秸秆粉碎不符合要求。有的地块粉碎后的秸秆过长，其长度大于１０厘米，不利于耕翻，影响播种。
三、土壤大小孔隙比例不合理。秸秆还田后，使土壤变得过松，大孔隙过多，导致跑风，土壤与种子不能紧密接触，影响种子发芽生长，使小麦扎根不牢，甚至出现吊根。
那么，怎样才能弥补以上缺陷，稳产、高产呢？
一是补施氮、磷、钾肥料。秸秆还田后，增施氮肥，可降低土壤中的碳氮比，从而利于微生物的活动，满足幼苗生长对氮素的需要，秸秆分解加快，又可为小麦中后期生产提供各种养分。按比例补施氮、磷、钾肥料，可满足小麦生长的需要，提高作物产量。其用量为每亩施碳铵１５公斤，过磷酸钙２５公斤，硫酸钾１０公斤；二是粉细深翻。秸秆粉碎长度宜小于１０厘米，均匀撒于地表，然后深翻入土，以利播种；三是提高播种质量。秸秆还田的地块，若采用普通型耧腿小麦播种机，播种时易壅土，影响播种质量，应采用与之配套的旋转式（转盘式）播种机，以提高播种质量；四是适时镇压浇水：小麦播种后，晾晒一天，用石磙镇压，使土壤密实，消除大孔洞，大小孔隙比例合理，种子与土壤紧密接触，利于发芽扎根，可避免小麦吊根现象；五是消灭病原体。带病的秸秆不能直接还田，否则夏季玉米易发生病害，这类秸秆应销毁或高温堆腐后再施用。