木瓜用于舒筋活络、强身健骨效果，是很好的大众化保健饮品。木瓜病毒以立枯病防治为主，7-8月发病重。初发病时，在叶片上出现褐斑，后扩大为黑褐色，严重时叶面布满病斑，导致叶片枯死。发生此病，生长期可喷施"绿乳铜"予以防治，同时搞好冬季清园消毒工作。虫害主要有食心虫、菜青虫、蚜虫等，发生后可喷"菊乳油"、"功夫乳油"等杀虫剂予以防治。发现天牛，成虫可人工捕捉，幼虫可用药棉蘸敌敌畏原液塞入蛀孔内，用黄泥封实洞口毒杀幼虫。
番木瓜环斑病毒在番木瓜生产上造成严重的损失。已研究了多种控制病害的措施，单独用一种防治方法不能有效地控制番木瓜环斑病毒，需要综合使用各种措施以达到防治病害的防治效果。