种植有机蔬菜利润少投入大，国内生产者大多选择放弃，不少业内人士指出，有机蔬菜是大势所趋，但尚需时日。在有机蔬菜的生长过程中，施肥可不能盲目，会造成不良后果。
微肥不宜施用量过大。蔬菜施用微肥，可使蔬菜优质高产，但微肥施用量要适当，施用量过大会对蔬菜产生危害。
硝酸铵和其它硝态氮肥一般不宜施用于蔬菜。因为硝态氮肥会使蔬菜中的硝酸盐含量增加，硝酸盐在人体中容易被还原成亚硝酸盐，对人体危害较大。
叶菜类蔬菜忌叶面喷施氮肥。因为蔬菜叶面喷施氮肥后，其铵离子与空气接触后，易转化为酸根离子，被叶片吸收，加上叶菜类蔬菜生育期短，很容易使硝酸盐积累在叶内，人们食用后容易引起食物中毒。
氯化铵、氯化钾等含氯化肥不宜施用于番茄、马铃薯、胡萝卜、白萝卜、红薯、山药、球茎茴香等。因为含氯化肥在土壤中分解后，铵或钾离子会被土壤吸附或被蔬菜吸收，浓度达到一定程度时会对蔬菜根系产生危害，严重时会造成蔬菜死亡。
有机蔬菜生产与常规蔬菜生产的根本不同在于病虫草害和肥料使用的差异，其要求比常规蔬菜生产高。
1、施肥种类主要有以下几种：
农家肥。如堆肥、厩肥、沼气肥、绿肥、作物秸秆、饼肥等。
生物菌肥。包括腐殖酸类肥料、根瘤菌肥料、磷细菌肥料、复合微生物肥料等。
绿肥作物。如紫云英、田菁、紫花苜蓿、大豆、箭舌豌豆等。
有机复合肥。通过微生物工程制造的有机肥料。
2、生产有机蔬菜，施肥应注意哪些问题？
人粪尿及厩肥要充分发酵腐熟，通过生物菌沤制，并且追肥后要浇清水冲洗。另外，人类尿含氮高，在瓜类及甜菜等作物上用量要适当，不宜过多。
秸秆类肥料碳氮比大，在矿化过程中易引起土壤缺氮。要求在作物播种或移栽前及早翻压入土。如果翻压入土与作物播种或移栽时间接近，要配施少量氮肥。
绿肥一般都在其花期翻压，翻压深度为10～20厘米，每亩翻压1000～1500公斤，可根据绿肥的分解速度，确定翻压时间。
有机复合肥一般为长效性肥料，在施用时，配施肥，以提高肥效。
1、人粪尿及厩肥要充分发酵腐熟，通过生物菌沤制，并且追肥后要浇清水冲洗。禽畜粪便、作物秸秆等有机废弃物由于可能含有较多的病菌、虫卵、草籽等，容易引起蔬菜病虫害，另外也会通过蔬菜传播一些对人类健康有害的疾病。此外，直接施用的有机废弃物在田间会进一步发酵，产生大量热量，易引起烧苗。因此提倡施用腐熟的有机肥料或商品有机肥料，可限度的避免上述事件的发生。如施用半腐熟有机肥料应与根系之间用土隔开。人粪尿含氮高，在薯类、瓜类、甜菜等作物上不宜过多施用。
2、施用方法要科学。有些有机肥料肥效长，养分释放缓慢，一般应作基肥，结合深耕施用有利于土肥相融，促进水稳性团粒结构的形成，有效的改良土壤。作物生长期间施用有机肥料，应开沟条施或挖坑穴施，施后及时覆土，切不可撒于地表。
3、要合理搭配施用。有机肥料品种之间应该注意合理搭配施用，才能充分发挥肥料的缓效与相结合的优点。如羊粪中养分含量在家畜粪便中，分解速度较快，肥效较猛，为达到肥效平稳，应在羊粪中加入猪粪或牛粪混合施用；人粪尿是性有机肥，施用时应搭配粗纤维含量较高的厩肥。