目前为止，搜集到的防治根结线虫的方法有很多种，今天，小编来重点说说农业防治与化学防治这两种方法。
农业防治方法具体可分为高温闷棚、大水漫灌、生石灰翻地、选择砧木嫁接、换茬及换土、选择抗病品种等方法；化学防治包括熏蒸剂（即土壤）、颗粒剂、冲施浇灌及生理期使用的生物制剂等。使用效果表明，化学防治能从根本上根结线虫，农业防治只能去除一部分，因此，化学防治要优于农业防治。
然而在防治根结线虫上效果却总是不好，年年治却年年发生？究其原因，除了根结线虫的生活特性和发生特点外，还有一个重要因素是农民对药剂的根本特点掌握不清，施用方法不当，从而无法制定一个合理的方法进行施用。那么又该如何正确的施药呢？在施药过程中，不管是采用穴施法还是沟施法，都要把穴挖得坡度平一点，沟底要宽，再进行撒药，并使用工具把土翻一下，然后使用一部分药剂洒在沟的表面，这样就能将生根的部分保护住，控制根结线虫的发生。同时，施药时保持一定的土壤湿度以便药效的发挥，推荐在移栽前1-2天施用，以达到较好的防治效果，这就是有效防治根结线虫的施法。
另外，在农产品种植过程中，使用噻唑膦颗粒剂，能有效降低土壤中二龄幼虫的数量，从根源上减少根结线虫的侵染源。一般在使用90-100天后，能达到对根结线虫的控制量，短期生长的作物一季使用一次就可以。同时，噻唑膦颗粒剂还能够抑制线虫的移动，即使根结线虫一年从头到尾处于不断运动过程中，也只能够移动90厘米左右，所以，要控制根结线虫，不让它们“跑”到根尖生长点周围，这样才能保护整个根系。