脐橙施肥有土壤施肥和根外追肥两种，以土壤肥为主。
(1)土壤施肥：土壤施肥既要利于根系尽快吸收肥料，又要防止根系遭受肥害。因此，施肥应做到因时、因树、因肥制宜。坚持根浅浅施、根深深施、春夏浅施、秋冬深施；无机
氮浅施，磷钾肥、有机肥深施。秋冬施肥应结合深翻扩穴改土，压埋绿肥；磷肥易被土壤固定，与腐熟的有机肥混合深施效果好。
土壤施肥有各种方法，脐橙幼龄树采用环状沟施；成年脐橙结果树采用条状沟施；梯地台面窄的脐橙树采用放射状沟施。鉴于脐橙果树是深根性作物，根系主要分布在40～80厘米深处，施肥的位置应在树冠滴水线以外，不能在主干下近主根处。
①环状沟施肥：按树冠大小，以主干为中心，在树冠外缘附近开环状沟，沟深浅依据根系分布深浅而定，一般深20～30厘米，宽30厘米。环状施肥的优点是省肥，简便易行，但面积小，易伤根，常用于幼树施肥。
②放射状施肥：根据树冠大小，在树盘内挖4～6条放射状沟，沟宽30厘米左右，靠近主干处宜浅，向外渐深。此法伤根少，隔年或隔次变更施肥部位，以扩大施肥面积。
③条状沟施肥：在脐橙树行间或株间开条状沟，深、宽各30厘米，施肥后覆土填平；分年在株间、行间轮换开沟，适用于成年脐橙园，尤其是封行的脐橙园施肥。
④穴状施肥：在树冠外缘均匀地挖穴4～8个，穴深20～30厘米，宽30厘米，肥料施入穴内，待渗下后再覆土。穴状施肥方法简单，伤根少，但施肥面积小，适用于施液体肥料。
⑤全园施肥：将肥料均匀撒施全园，再翻入土中。适用于根系布满全园的脐橙成年果园，但施肥深度浅，易引根系上长，应与其他方法交替使用。
(2)根外追肥：根外追肥又叫叶面施肥。用于叶面喷施的氮肥主要是尿素、硫酸铵和硝酸铵等，且以尿素；磷肥主要是磷铵(含磷酸二氢铵和磷酸氢铵的混合物)、过磷酸钙、磷酸二氢钾、磷酸氢二钾等，其中以磷铵效果为。过磷酸钙作叶面施肥，用前用水浸泡一昼夜后，按所需的浓度配制；钾肥，主要是磷酸二氢钾、硫酸钾、氯化钾、硝酸钾和磷酸氢二钾等，以磷酸二氢钾。
施肥时为了节省工时，通常将不同的肥料混合施用，同时满足脐橙生长发育对营养元素的要求，且有时肥料的适当混合能提高肥效。