脐橙的幼树期、初结果期、成年(结果盛期)树期和衰老更新期的施肥时期、肥料种类也有不同。
(1)幼年树：脐橙幼树施肥以
氮肥为主，其次是
钾肥，磷肥再次。施肥的重点是攻(促发)春、夏、秋各次梢，使其抽生整齐，生长健壮。施肥次数因幼树根系弱，生长范围小，吸肥力弱，施肥宜少量多次，勤施薄施。一般在每次梢抽发前7～8日天各施一次催梢肥，在顶芽自枯至新梢转绿时再施一次壮梢肥。通常 11月加施一次基肥，1年施7～9次。此外，还可结合喷施农药进行根外追肥，肥料有氮、钾、磷和微量元素，生产上常用尿素、磷酸二氢钾等，1年可喷施3～4次，通常在各次梢新叶转绿前喷施。
(2)初结果树：脐橙初结果树是指栽植后4～6年的树。施肥的重点是促发足够数量的结果母枝。由于脐橙初结果树主要的结果母枝是二次梢的春秋梢和一次梢的春梢、早秋梢，故施肥主要围绕促发春秋梢、春梢和早秋梢，重施春肥、秋肥和采后肥。为控制夏梢、晚秋梢，一般不施夏肥，以达壮梢、保叶保果和减少夏季落果。一般1年施4～5次肥。
(3)成年结果树：成年结果树，其施肥一般根据抽梢、开花和结果等物候期确定。常施催梢肥、稳果肥、壮果肥和采果肥。催梢肥：在春梢发芽前 10～15天施入，以性氮肥为主，以促春梢整齐、健壮生长，为翌年提供充实的结果母枝。稳果肥：由于脐橙抽发春梢、开花谢花和次生理落果等消牦养分多，如不加补充会加剧第二次生理落果，故在5月中、下旬施一次以氮肥为主、配合磷肥的稳果肥。壮果肥：目的是壮果，在稳果后秋梢抽生前施。肥料以复合肥或腐熟的饼肥、优质粪肥为主，磷钾肥配合。采果肥：在果实采收前后施入，以促树势恢复、花芽分化和增强树体越冬能力。肥料可用厩肥、堆肥等有机肥和复合肥。
(4)衰老更新树：脐橙进入衰老更新期产量明显下降，树冠开始向心生长，树冠中、下部枝，内膛枝郁闭，枯枝增多；根系生长减弱，吸肥力减退，叶少花多，坐果率下降。对脐橙衰老更新树应地上部与地下部同时采取措施：地上部修剪，地下部适当断根施肥，使之更新复壮。施肥可结合2月中、下旬，7 月上、中旬和9月上旬断根增施有机肥，促进根系生长，同时也可在脐橙萌芽、抽梢时施氮肥，促进春梢、夏梢、秋梢抽发整齐，使重剪后的植株迅速恢复树势。