微生物菌剂，是指目标微生物（有效菌）经过工业化生产扩繁后加工制成的活菌制剂。
它具有直接或问接改良土壤、恢复地力，维持根际微生物平衡，降解有毒、有害物质等作用。
应用于农业生产，通过其中所含微生物的生命活动，增加植物养分的供应量或促进植物生长、改善农产品品质及农业生态环境。
复合微生物菌剂的作用
1、促进快速生长：
微生物在土壤内的生命活动过程中，会产生大量的赤霉素和细胞类等物质，这些物质在与植物根系接触后，能调节作物的新陈代谢，刺激作物的生长，从而使作物产生增产效果。
2、调节生命活动，增产增收：
有益微生物菌群代谢产生的植物内源酶和植物生长调节剂经由根系进入植物体内，促进叶片光合作用，调节营养元素往果实流动，膨果增产效果明显。与施用化肥相比，在等价投入的情况下可增产15%—30%。
3、果实品质明显提高：
菌群中的侧孢芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、凝结芽孢杆菌等可降低植物体内硝酸盐含量20%以上，能降低重金属含量，可使果实中Vc含量提高30%以上，可溶性糖提高2—4度。果实口感好，耐储藏，卖价高。
4、分解有机物质和毒素，防止重茬：
菌群中的米曲菌、地衣芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌等有益微生物能加速有机物质的分解，为作物制造养分、提供动力，能分解连作有毒有害物质，防止重茬。
5、根际环境保护屏障：
菌群中的地衣芽孢杆菌等有益微生物施入土壤后，迅速繁殖成为优势菌群，控制根际营养和资源，使重茬、根腐、立枯、流胶、灰霉等病原菌丧失生存空间和条件。
6、增强抗逆性：
菌群中的地衣芽孢杆菌、芽孢杆菌、侧孢芽孢杆菌等有益微生物可增强土壤缓冲能力，保水保湿，增强作物抗旱、抗寒、抗涝能力；同时侧孢芽孢杆菌还可强化叶片保护膜，抵抗病原菌侵染，抗病，抗虫。
7、能松土保肥、改善环境：
丰富的有机质还可以改良土壤物理性状，改善土壤团粒结构，从而使土壤疏松，减少土壤板结，有利于保水、保肥、通气和促进根系发育，为农作物提供适合的微生态生长环境。
8、有益菌刺激有机质释放营养：
菌群中的芽孢杆菌、胶冻样芽孢杆菌等有益微生物在代谢过程中产生大量的植物内源酶，可明显提高作物对氮、磷、钾等营养元素的吸收率，达到肥效持久的目的。
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