谷子重茬会造成的害处有下面几点：
一、谷子病害发生严重 由于连作，形成了特殊的土壤环境，使有益微生物的生长繁殖受到抑制，而有害微生物大量滋生，土壤就会发生变化。谷子重茬后一些病害特别是白发病发生较重，因为该病是土传病害，连年种植病害会逐年加重。
二、容易造成草荒 谷莠草是谷子伴生杂草，谷莠草子埋在土壤里，多年仍能保持发芽力 ，只要翻到土壤表层就可以发芽，谷莠草分蘖多，生命力强，成熟早，易脱粒，所以连作容易造成草荒。
三、“自毒作用”明显 某些作物可通过地上部分淋溶、根系分泌和作物残茬腐解等途径释放一些物质，对同茬或下茬或同科作物生长发育产生抑制作用，这种现象叫自毒作用。谷子根系发达，吸肥力强，连年种植会大量消耗土壤同一营养元素，造成竭地，致使营养元素失衡，对谷子生育带来不利，也会影响下茬作物。
因此，谷子种植须合理轮作换茬，以调节土壤养分，恢复地力，减少病虫草害。特别是病害严重的地块，隔三年再种谷子。谷子的前茬以豆科作物，玉米、小麦、甘薯等次。