深层施肥料能够提高肥料效果，在使用深层施肥过程中被作物慢慢吸收利用。有四种施肥方式：
1．耕田深施。这是深层施作基肥的一种方式。做法是在耕田前将田水排至近干，然后将肥料均匀撒布在田面上，再进行犁翻与耙平，随后插秧。
2．面层深施。这是深层施作基肥的另一种方式。做法是在插秧一次犁翻后，即将肥料撒布在田面上，然后耙田后插秧。
3．球肥深施。这是追肥的一种方式。做法是将化肥与肥泥和水按一定的比例制成球肥，每个重约100克左右。追肥是将一个球肥塞入每4棵禾苗中间，深度7厘米～10厘米。
4．液体深施。这也是追肥的另一种方式。做法是将化肥或农家肥用水配制成肥液，然后用施肥器施入土壤中，深约10厘米为宜。水稻深层施肥的方式主要有以上几种，其中以球肥深施的效果，深层施肥以追肥为好。
作物丰产的许多因素中，水和肥是其中两个重要的因素。俗话说得好，“有收无收在于水，收多收少在于肥”。这说明，能否及时灌水，作物对水分的需求是作物生长的限制因素。同样，能否合理施肥及时满足作物对养分的需要是决定作物产量的关键。