深层施用肥料能够提高肥料效果，施用具有很多的好处：
1．能利用下层土壤胶体吸附铵离子，免于挥发损失。
2．施到下层后避免了铵态氮反硝化作用而脱氮损失。
3．避免了地表径流的流失作用。
4．避免了土壤表层杂草等植物吸收。
5．避免了作物前期暴生暴长，后期缺乏养分的不正常现象发生。
6．过磷酸钙制成球肥深施，减少了土壤的接触面积，减轻了磷被土壤固定的作用，因而提高了肥效。
一般耕地只有一铁锹的深度，也就二三十公分吧，深耕就是耕得更深，比如拖拉机耕。有时把一般耕地也叫做深耕了，所谓深耕细作。
深耕具有翻土、松土、混土、碎土的作用，深耕首先能改善土壤结构，增加土壤的底墒。深耕可以疏松土壤下层，使土壤的含水部位下移，增加土壤的含水量，即增加土壤的底墒。农谚所说的“深耕一寸土，多耐十天旱”就是这个道理。②能加强土壤的透气性，从而提高了土壤中的有效养分。③有利于消除杂草和病虫害。④促进根系发育，增加农作物的产量。⑤可深层施肥，有利于逐步熟化下层土壤，增加根系吸收营养范围。
怎样进行深耕？应注意哪些问题？实施农田深耕工作，牵涉到千家万户，是一项复杂的系统工程，应高度重视，加强引导，因地制宜，循序渐进。要因地制宜确定适宜的深度，既要根据当地的土质、耕层、耕翻期间的天气和种植作物等条件，还要考虑劳力、农机具和肥料的情况；要循序渐进，逐渐加深耕层，切忌将深土层的生土全部翻入耕层；深耕的同时，应配施有机肥、加大施肥量，加速土壤肥力的恢复，如果翻耕前后持续干旱，要注意浇水造墒。