枯草芽孢杆菌是一种对作物、对土壤都有很好的生长调节作用，基本是多功能的，不可能只针对一点起作用，重要的是它的使用效果是累加的，是单纯的肥料或激素达不到的。
研究表明枯草芽孢杆菌对改善土壤、提高农作物品质有以下作用。
1、抗生作用
抗生作用是指微生物通过产生代谢产物在低浓度下就能够对病原微生物的生长和代谢产生抑制作用，从而来影响病原微生物的生存和活动。
2、诱导植物产生抗性及促进植物生长
枯草芽孢杆菌不但能够抑制植物病原菌，而且还能够诱发植物自身抗病机制从而增强植物的抗病性能的作用。枯草芽孢杆菌的抗逆性强、功能多、适应性广、效果稳定。枯草芽孢杆菌能够产生类似细胞分裂素、植物生长激素的物质，促进植物的生长使植物抵抗病原菌的侵害。
3、保护环境
枯草芽孢杆菌大量应用于微生物肥料。当作用于作物或土壤时，能够在作物根际起到特定肥料效应。目前，微生物肥料在培肥地力，提高化肥利用率，抑制农作物对重金属、农药残留的吸收，净化和修复土壤，降低农作物病害发生，促进农作物秸秆和城市垃圾的腐熟利用。提高农作物产品品质和食品等方面表现出了不可替代的作用。
4、枯草芽孢杆菌对盐碱地的改良
土壤内盐分积累的危害土壤结构黏滞，通气性差，土温上升，好气性微生物活动差，养分释放慢，渗透系数低，导致表层土壤盐渍化进一步加剧，造成土壤冷、硬、板现象。微生物菌肥中的枯草芽孢杆菌对于改良盐碱地有显著效果，有效调节土壤PH值，快速盐碱，活化土壤养分，改善土壤环境。
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