导致瓜果烂根的病害种类非常多，非常让农民头疼，每种作物都有一种或几种常发、主发病害。在此，总结出来，农户朋友了解后，在以后的防治中可以有所借鉴。
一、辣（甜）椒疫霉根腐病
1、主要症状：主要为害甜、辣椒茎基部及维管束，病株部分枝和叶片变黄萎蔫，茎内维管束褐变，湿度大或生育后期茎基部或根茎部腐烂，门椒开始膨大后，植株茎叶出现萎蔫，到后期整株萎蔫。该病多始发于茎基部表皮，菜农俗称“黑秆子”，后病菌向内向下蔓延，终导致辣（甜）椒死棵。纵剖茎基或根部，木质部呈水渍状深褐色，根茎腐烂。高湿条件下病部产生白色绵絮状霉状物。这是区别于菌核病的重要特征。
2、发病时期：菜农普遍反映，辣（甜）椒定植前后，土壤湿度过大，且持续时间长时发病严重；或者遇连阴天棚内低温高湿，尤其是大水漫灌后都会导致该病的发生和流行。
3、防治措施：许多菜农采用“三菌一药”法防治疫霉根腐病效果很好。即从辣椒分苗到开花结果期分别施用3次嘉美红利，定植后半个月左右用一次药灌根。次施用嘉美红利，是在辣椒分苗时用其蘸根。用一袋嘉美红利兑水500斤与95%恶霉灵2000倍、细土若干、少许水混匀搅拌成糨糊状，用以蘸根后移苗。第二次在定植前穴施嘉美红利。用红利均匀地拌上细土撒入穴内，其用量是一袋兑10斤细土撒施300穴。也可顺着种植行包在垄上施用，效果也较好。第三次是在开花结果期使用嘉美红利兑水600斤灌根。一药指在开花初期（在定植后17天左右）用金雷1000倍（甲霜灵与代森锰锌的复配剂）混入福美双600倍、农用链霉素3000倍灌根。
4、专家建议：若棚内疫霉根腐病发生严重，可用72.2%普力克600倍液（20克一桶水）混金雷800倍液（35克一桶水）混杜邦福星3000倍液（5ml/袋对一桶水）进行防治。
二、黄瓜拟茎点霉根腐病
1、主要症状：嫁接黄瓜一般定植后生长正常，结果后开始陆续发病，结瓜高峰期发病较重。植株病情发展较缓慢，初期晴天中午叶片萎蔫，早晚或阴天可恢复，持续5-7天后植株叶片由下全部萎蔫呈青枯状死亡，发病重时嫁接部位以下用作砧木的南瓜茎基部呈褐色水渍状萎缩变软，挖取砧木根部可见部分主根和侧根变为浅褐色至褐色，严重时根部全部变为褐色或深褐色，须根腐烂且基部发生纵裂，裂口内带有黑带状菌丝块，表皮密生小黑点。
2、发病时期：发病部位为根茎部。嫁接黄瓜幼苗期和结瓜初期易发病。
3、区别要点：一是嫁接苗属于黑籽南瓜部分近地面的茎基部出现水浸状变褐腐败，致使全株死亡。二是茎基部不出现水浸和腐败症状，南瓜和黄瓜的维管束也不变褐，掘取根部可见细根基部变褐腐烂，主根和支根的一部分也出现浅褐色至褐色，严重时根部全部变深褐色，后细根基部全部发生纵裂。
4、防治措施：预防拟茎点霉根腐病，要采取综合措施。总结菜农成功的经验，可采取更换砧木结合穴施嘉美红利或药剂的措施。
用白籽南瓜代替黑籽南瓜，加强肥水管理，增施嘉美海力宝、赢利来等提高植株自身的抗病能力。穴施嘉美红利或药剂（倍生、苗菌敌等），重点保护根系，减少病菌侵染的几率。可用苯醚甲环唑（世高）1000倍液混加咯菌腈（适乐时）1500倍液灌根。在这个预防前提下，若发现病株，可用氯溴异氢脲酸1000倍、恶霉？甲霜600倍、嘉美红利等药剂灌根防治。
三、西红柿茎基腐病
1、主要症状：幼苗定植过深或茎基部渍水、培土过高等易发生此病，该病主要为害大苗或定植后番茄的茎基部或地下主侧根，病斑呈暗褐色，绕茎基或根茎扩展，致使皮层腐烂，地上部叶片变黄，果实膨大后，因养分供应受阻逐渐萎蔫枯死。后期病部表面常形成黑褐色大小不一的菌核。主要为害大苗茎基部或地下部主侧根。病部初成暗褐色，后沿茎基部或根部扩展，致使皮层腐烂植株因缺水萎蔫死亡。
2、发病时期：茎基腐病发病适温为24℃，所以在每年7-10月份棚内温度较高时发病为集中。在12月到翌年二月，因棚内温度较低，发病较轻。
3、防治措施：幼苗定植之前，可每亩使用50%福美双可湿性粉剂2kg，加细土均匀撒于地面，进行土壤消毒。定植时，使用95%恶霉灵5000倍液进行蘸根，防止病菌的侵染。发病后可用20%甲基立枯磷或30%苯噻氰1200倍液进行喷雾防治，对于发病严重的植株，菜农还可使用78%科博可湿性粉剂200倍液涂抹病部，进行重点防治。
感染茎基腐病时，根系会严重受损，因西红柿茎部也有较强的生根能力，菜农可将西红柿植株下部的1-2片叶疏除，将茎部长5-8厘米放平压土，以促发不定根，促进植株的生长。
四、茄子枯（黄）萎病
1、主要症状：茄子黄萎病的苗期发病少，成株多在坐果后开始出现症状，以结果初期发病盛。多由植株下、中部开始出现症状，而后向上或从一边向全株发展。叶片初在叶缘及叶脉间褐绿变黄，后发展至半边叶片或整片叶片变黄，早期病叶晴天高温时呈萎蔫状，早晚尚可恢复，后期病叶由黄变褐，干枯脱落。劈开病根，茎、分枝及叶柄等部位，可见其维管束变黑褐色。
茄子枯萎病多发生在成株期，在温度达25-28℃土壤潮湿时，极利于发病，病株叶片自下向上逐渐变黄枯萎，病症多表现在一、二层分枝上，有时同一叶片仅半边变黄另一半健全如常。病情严重时，整株叶片枯黄，横切病茎、病部维管束呈黑褐色。
两种病害发病症状相似，不易区分。两者都是结果期发病重。小编通过在棚内观察、查阅相关资料，总结出两者的不同点。茄子枯萎病病症多表现在一二层分枝上，且一般为半身不遂（即整株茄子一半发病，而另一半正常生长）；而黄萎病为全株性病害。
2、防治措施：这两种病直接有效的防病方法是嫁接。枯萎病病菌一般在土壤表层，建议在夏天进行高温闷棚，杀死土壤表层的菌群，然后结合土壤深翻，每亩地施入多菌灵和福美双（每亩地用4公斤左右）进行土壤消毒，防治效果较好。而黄萎病病菌一般在土壤深层，建议蔬菜定植后，及时用多菌灵、福美双打眼灌根。
五、芸豆炭疽病
红根是芸豆根部病害的通称，而炭疽病则是导致芸豆红根的主要病害。
1、主要症状：芸豆炭疽病，幼苗发病，子叶上出现红褐色近圆形病斑，凹陷成溃疡状。幼茎上生锈色小斑点，后扩大成短条锈斑，常使幼苗折倒枯死。成株发病，叶片上病斑多沿叶脉发生，成黑褐色多角形小斑点，扩大至全叶后，叶片萎蔫。茎上病斑红褐色，稍凹陷，呈圆形或椭圆形，外缘有黑色轮纹，龟裂。潮湿时病斑上产生浅红色粘状物。果荚染病，上生褐色小点，可扩大至直径1厘米的大圆形病斑，中心黑褐色，边缘淡褐色至粉红色，稍凹陷，易腐烂。根系表皮出现类锈病条状红斑，表皮粗糙、皲裂、甚至干枯腐烂。毛细根很少甚至没有新根，植株生长变缓，叶片由下而上叶片发黄。
2、发病时期：芸豆炭疽病在老棚地块发病较重。在施肥不当、大水漫灌、种植过密的地块，该病发生也很严重，这与肥大伤根、水大沤根导致芸豆根系形成伤口、抗病能力下降易被炭疽病原菌侵染有关。
3、防治措施：穴施红利或药剂防病。定植时穴施嘉美红利+恶霉灵，预防炭疽病。也可用50%多菌灵可湿性粉剂加50%福美双，1000株用药1斤，加细土20斤拌匀，撒于穴内，预防病害发生。
4、灌根防治：病害发生后，建议用甲基硫菌灵或恶霉灵或乙膦铝锰锌或氯溴异氰尿酸等药剂任选一种，加入红利强力壮根剂，进行灌根，芸豆苗期4两至半斤药液，成株期可增加至1斤水，连灌2-3次，5天1次。
六、西红柿根腐病
1、主要症状：西红柿根腐病主要危害西红柿根部，发病初期于主根和茎基部产生褐色斑，后逐渐扩大、凹陷，严重时主根变褐腐烂，导致地上部逐渐枯萎。纵剖茎基部或根部，维管束变为深褐色，之后根茎腐烂，不生长新根，发病后期，病株多枯萎而死。
2、发病原因：西红柿根腐病病原属半知菌亚门真菌，病菌以菌丝体和卵孢子随病残体在土壤中越冬。在苗床内传播主要是带菌的土壤、农具和浇水等。病菌从幼苗伤口侵入，再借雨水、灌溉水传播。高温、高湿宜于此病发生。苗床连茬、地面积水、施用未腐熟的肥料、地下害虫多、农事活动造成根部伤口多的地块发病较重。
3、防治措施：
（1）农业措施。做好苗床土壤消毒工作，培育无病壮苗。平整土地，做好排灌系统、高畦栽培。重病地与非茄果类、瓜类蔬菜实行3年以上轮作。加强水肥管理，适时适量灌水，浇小水，切忌大水漫灌。雨后及时排水，浇水后及雨后适时中耕松土。施用充分腐熟的粪肥，增施有机活化营养、磷、钾、钙套餐肥嘉美红利、海力宝、赢利来，避免肥料施用不当根系。初见发病植株及时拔除烧毁。
（2）药剂防治。发病初期及时进行药剂防治，用40%乙膦铝可湿性粉剂200倍液或72.2%普力克水剂400-600倍液浇灌苗床，每平方米苗床用药液量2-3公斤；或在移栽前用72.2%普力克水剂400-600倍液浸苗根，也可于移栽后用72.2%普力克水剂400-600倍液灌根。