深施磷易被土壤中的钙、镁、铁、铝等固定，而且移动性小，因此应把磷肥深施在作物根系附近，可以增加磷肥与根系的接触机会，既有利于作物吸收又减少杂草消耗，可提高利用率。可利用拌种、条施、穴施等，效果很好。
早施：
磷肥作基肥要早施，因作物需磷关键期是苗期。苗期不缺磷，作物生长中后期很少出现缺磷症状，故磷肥作基肥作用好。
混施：
磷肥与质量较高的厩肥或堆把等有机肥混合堆沤后，可使磷肥中难溶性的物质转化为作物能利用的有效磷，同时由于磷肥与有机肥堆沤，减少了土壤的直接接触，可减少磷的固定，提高肥效。
不宜单施：
磷肥不要单独施用，与氮肥配合施用。氮、磷、钾按比例施用的增产效果与生产效益，比单施任何一种都佳，一般氮、磷、钾比例为1：0.4：1.2为好适量施用磷肥肥效长，基施1次可管2―3茬，所以，不必每茬作物都施磷肥，一般1―2年基施一次即可。同时要根据不同作物目标产量和土壤肥力计算适当用量，考虑氮、磷、钾三要素的平衡。
根外追肥：
农作物在开花前后用过磷酸钙进行根外追肥，作物生长后期根系老化，吸取养分能力减弱，常造成脱肥，时用水溶性磷肥喷施效果很好，喷施浓度0.5―2%，时间宜早上或傍晚。
因土而施：
磷肥即过磷酸钙是酸性肥料，适宜中性、碱性土壤施用，钙镁磷用在偏酸性土壤中。
因作而施：
磷肥适合于对磷特别敏感的作物，重点应用在豆类、棉花、小麦、薯类、瓜类上，经济效益较好。另外，磷肥要集中施用，“施肥一大片，不如一长线”说的正是此意，用量少，效果大。
不能与碱性肥料混施：
草木灰、石灰等均为强碱性物质，若混合施用，会使磷肥的有效性显着降低，对补磷增产利，一般应错开7―10天施用。