用畜禽粪便等有机废弃物质经充分发酵腐熟后加工而成的属于合格的农家肥，但是决定所生成的农家肥的质量好坏与发酵与否、发酵腐熟程度、发酵的方式方法有一定的关系。一般情况下经过以下几个简单判断的方法来判断所沤的农家肥是否合格。
日常简单常用的办法有：
1.通过肉眼看其颜色：那些只经过纯粹的物理方法干燥过的农家肥，仍保持着原粪便的颜色，不同的是水分减少而已。在通过堆肥技术手段的处理，特别是经过优质发酵助剂进行发酵，经过发酵腐熟后的农家肥的成品颜色变为褐色或黑褐色，而且在成品中基本上没有其它杂质。
2.用手摸看手感：优质的腐熟的农家肥用手抓一把，它的手感一致，如果是有水分的时候很柔软并且有弹性，干燥的时候很脆并且容易破碎，但是那些劣质不合格的农家肥用手抓可以摸到沙子等杂质。
3.用水泡看状态：经过清水浸泡后的优质和低劣的农家肥，在几分钟之后，可以看到优质的农家肥在水中的分布很均匀，而劣质的农家肥的就可以看到所乘容器底部会沉入很多沙子或泥土，一看就知道其明显的差距。
复杂一点但更准确的方法有：
1.塑料袋法（以畜禽粪尿为主的堆肥）：将经过发酵后以畜禽粪尿为主的农家肥产品装进塑料袋密封好。如果发现塑料袋不鼓胀，就可以断定该堆肥产品已腐熟，反之就未腐熟（因为没有发酵熟的肥料会产生气体）。
2.发芽试验法：提取堆沤的农家肥风干的产品5g放入200mL烧杯中，加入温度为60℃的温水100mL浸泡3小时后进行过滤，将滤出来的汁液取出10mL，倒进铺有两层滤纸的培养皿，将100粒白菜、萝卜、黄瓜或番茄的种子排序种植，等待发芽实验，成为实验组。另外设置对照组，其培养皿中使用的是蒸馏水，种子与发芽试验方法与上相同。经过两组实验对照，如果实验组的发芽率为对照组的90%以上，就可以说明改农家肥产品已腐熟合格。
3.蚯蚓法：准备几条蚯蚓、一个杯子、一块黑布。在杯子里放入弄碎的农家肥产品，之后把蚯蚓放进去，并将准备好的黑布盖住杯子，经过观察，如果发现蚯蚓潜入产品内部，表示腐熟，如果只是爬在产品上面不愿潜入堆中，表示产品没有充分的腐熟，其内部应该还会含有苯酚或氨气残留。
4.观察法：可以通过观察有机基质与堆肥呈暗褐色或黑褐色，有氨臭和黑色汁液。还有秸秆的农家肥富有弹性且松软，取堆肥上少量的农家肥加清水搅拌后（肥水比例1:5～10）静置3～5分钟，如果其浸出液呈现淡黄色，表明该肥已经腐熟，还可以观察肥堆的体积的变化来判断，如果肥堆比刚堆积时塌陷1/3-1/2，也表明该肥已腐熟。