生物有机肥：是指特定功能微生物与主要以动植物残体为来源并经化化处理、腐熟发酵的有机物料复合而成的一类兼具微生物肥料和有机肥效应的肥料。
其特定功能微生物指：
能利用土壤中有机质为碳源、空气中二氧化氮为氮素，大量生长繁殖的固氮菌；能分解固结在土壤或土壤母质中磷、钾元素的解磷菌与解钾菌；能够拮抗土传病原菌生长、繁殖的有益菌。
原理：生物有机肥一般每克含特定量功能微生物，施入土壤后，在地温达25～35℃、PH值5.5～8.5、土壤持水量50～70%、无杀菌剂残留的适宜条件下，其固氮菌、解磷菌、解钾菌等有益菌约20分钟繁殖一代，呈几何级数增长。每一个有益菌就是一个肥源库，难以计数的有益菌的生长繁殖等于将肥料生产厂搬到了地下，源源不断地生产出氮、磷、钾及微量元素，供植物吸收利用，达到提高作物产量、品质；改善土壤，加深耕作层；减少病虫害发生的目的。