树头栽培是将茯苓菌丝接在砍伐后的松树头上，使之蔓延生长并结成菌核的栽培方法。采用这种方法的好处是：①可以利用资源，不占用松木材，更好地发挥经济效益。②可以就地取材就地栽培，方法简单，只要在背风向阳不积水、有松木头的地点都可栽培，不必象段木栽培那样严格选择苓场和砍树、截段及搬运段木等繁重的操作，节省劳力，③操作简便，产量也较高。在有松木资源的地区是一种比较理想的栽培方法。
1、清理场地：在冬季或春节前后，距树头2米以内的杂草、灌木、石块。铲去表土，每个树头周围深挖1米以上，并结合施药预防白蚁。翻土后，四周要开排水沟。
2、树头处理：一般砍伐4个月以上至一年半以内的松树头、树根，只要没有腐烂，没有虫蛀和感染杂菌的都可用来栽培茯苓。砍伐时间在3个月以内的，由于松脂含量较高，接种后不易传引成活，所以一般极少应用。树头和大的侧根，要象段木栽培一样在清理场地时，进行削皮留筋，形成2-3条浅槽以放置菌种用。并砍去距树头1米以外的细小侧根（放在树头晒于备用），以防止在远处结苓不易发现。
3、接种：接种时间一般以地温回升到10℃以上为宜，在南方约在，4-6月间。根据树头的高矮及接种方式的不同，可分高桩接种、矮桩接种和树根插入接种三种方法。
4、高桩接种：适用于高、细的树头。具体方法是：在树头近根处锯一高10-12厘米。深5-6厘米的缺口，将种木片竖放在缺口内，捆紧，用松针叶包着后覆土。
5、矮桩接种：适用于低矮树头。在近树头处的粗侧根侧面削去树皮2-3条，再将晒干备用的小侧根也削皮2-3条，并以削皮部位与粗侧根的削皮部位相靠，然后将种木片紧靠在两者去皮处之间，用松木片覆盖，捆紧。
6、树根插入接种：这是一种简便的接种方法，目前许多茯苓产区普遍采用。选生长在树头上坡的树根，削去前端的树皮，使树根的大小与菌种瓶瓶口直径相近，将树根直接插入菌种瓶内，注意瓶口向下，防止雨水侵袭菌种，影响成活率。接种2个月后可将菌种瓶取出。
7、覆土：接种后随即覆土，使成馒头状，高桩接种的如树头过高，也可将土堆至菌种上面4-7厘米处，上部树桩可露出上面一部分。并在四周开好排水沟。
8、管理：接种后1个月左右要检查种引成活情况。如接种没有成活要及时补种。下雨之后，如发现覆土被雨水冲走，应及时把冲散的泥上再次覆上，防止菌引或木引脱落，影响产量。一般接种后100天左右，开始形成菌核，附着菌核的不断增大，土壤出现裂缝，要及时盖土，防止晒裂。结苓阶段对水分要求比较迫切，如遇干旱，要培土保墒，灌水抗旱。此外，要注意预防白蚁的危害。
9、收获：茯苓成熟的标准是；苓场覆土不再出现新的裂隙，苓皮颜色开始变深，表面无白色花纹，菌核已变硬； 树头养料已经耗尽，颜色由黄色变为棕褐色，木质呈现腐朽状。即表示菌核已经成熟，树头中再无营养，可以收获。