甘薯入窖储存后不久即发霉长毛，是储藏期常见病害之一。这实则是由根霉属多种病菌引发的甘薯软腐病，病菌从薯块伤口侵入，病组织产生孢子后借气流传播。薯块损伤、冻伤后易受病菌侵染，发病适温度为15℃—23℃，相对湿度高、储藏环境中有水滴的部位易发病。
适时收获。避免薯块遭受冻害。同时，在甘薯收获全过程中需做到“四轻”（轻挖、轻装、轻运、轻卸），防止薯块破损。
适当晾晒。若在晴朗高温天气收获，可将薯块晾晒2—3天，待伤口愈合后入窖。条件允许时，可结合黑斑病防治开展高温愈合处理。
加强储藏期管理。窖温需保持在10℃—14℃，尤其储藏中后期，要注重防冻保温；若在甘薯堆表面发现病薯，需及时拣出。