普通番石榴是很容易腐烂的水果，极不耐贮藏。在常温下放置1~2天，番石榴就失去新鲜的风味，维生素C含量也降低。因此，番石榴除供鲜食的以外，其余的都应尽快将其处理加工成各种产品。若不能及时处理加工，也应尽快对其进行冷藏处理。
番石榴采后常规处理，是在采收后3~4小时内，使用特克多、扑海因、施保克和苯来特等商品剂，对果实进行防腐绅理。将处理后的番石榴，马上分级，包上泡沫网袋冷藏。冷藏条件以温度为8℃~10℃、相对湿度为85%~90%较适宜。这样处理可保鲜15~70天。
另外也可在果实上打蜡，既可增加果实表面的光泽，又能在一定时期内果实的水分不散失。冷藏前要进行适当包装，包装容器多用80~90厘米高的竹箩，每个竹箩装20~30千克果实。箩的四周可用碎纸等填充物垫衬，以免果实被擦碰伤。果实要分层排放。排放时要萼部向上放置，并略微倾斜，以免萼片刺伤上层果。到上层时，再盖一层碎纸，然后加上盖绑好，即可放入冷库贮藏，或放入冷藏车中运往销售地。将番石榴从产地运往销售地的过程中，若无冷藏设备，则必须尽可能避免日晒，在夜间运输。运进超市后，也应尽可能维持低温，以保持果品的新鲜。